Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
38 страниц V  1 2 3 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

SUDMED_2344_AMDISLIB_20170101.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

SUDMED_2344_NISTLIB_20170101.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED_2344_ACSLIB_20170101.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

SUDMED_2344_MSHUNLIB_20170101.mslibrary.xml - библиотека в формате Agilent MassHunter

SUDMED_2344_20170101.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED_2344_LIB_20170101_NEW.pdf - сведения об обновлениях

ReadMe.txt - инструкция по установке библиотек SUDMED

Сообщение отредактировал KSS17 - 2.01.2017 - 08:33


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  2753
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ReadMe.txt ( 1.82 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1692
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_MSHUNLIB_20170101.zip ( 849.75 килобайт ) Кол-во скачиваний:  212
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_ACSLIB_20170101.L.zip ( 907.86 килобайт ) Кол-во скачиваний:  210
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_LIB_20170101.pdf ( 804.52 килобайт ) Кол-во скачиваний:  419
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_LIB_20170101_NEW.pdf ( 9.56 килобайт ) Кол-во скачиваний:  354
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_AMDISLIB_20170101.zip ( 877.32 килобайт ) Кол-во скачиваний:  270
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_NISTLIB_20170101.zip ( 1.72 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  295
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 16.06.2008 - 21:51
Сообщение #2


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Тур, тур, тур…
Не надо выкладывать фирменные библиотеки.
Нам тут ещё не хватало нарушения авторских прав разбирать.
Только собственные данные и спектры.
Будем корректны.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 22:30
Сообщение #3


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Вы абсолютно правы, Коллега!
Не сомневаюсь, что у всех наших коллег есть необходимые им фирменные библиотеки на вполне законных основаниях.
Процедура конвертирования из формата .l в .msl достаточно подробно описана в документах "5989-0916EN_build_screener_libraries.pdf" и "5989-2249EN_build_DRS_libraries.pdf" из пакета ПО "Agilent G1716AA Integrated Deconvolution Reporting Software for the MSD Productivity ChemStation" и не представляет трудностей.

В данном посте я хочу опубликовать дополнительные файлы, созданные в нашей лаборатории, позволяющие производить поиск по базе PMW_TOX3 в программе AMDIS в режиме "Use RI Calibr.Data", используя индексы удерживания базы данных после калибровки колонки:
PMW.isl - внутренние стандарты (опционально)
pmw.csl - калибровочные стандарты (калибровка колонки для сопоставления времени удерживания и Индексов удерживания)
pmw.cal - таблица калибровки колонки (переписывается в процессе калибровки Вашей колонки в Ваших условиях)
pmw.ini - конфигурация АМДИСа.

Судебная медицина - Прикрепленный файл  PMW.zip ( 3 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1153
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 17.06.2008 - 20:57
Сообщение #4


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Выкладываю масс-спектры дезоморфина и некоторых его производных, для AMDIS.

Судебная медицина - Прикрепленный файл  Desomorphine.rar ( 4.98 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1454
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 18.06.2008 - 18:23
Сообщение #5


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Выкладываю масс-спектры сибутрамина, производных налидиксовой кислоты, скополамина и его производных, ацетилированного трамадола, зопиклона и производных продукта его гидролиза (в том числе 2-амино-5-хлорпиридина и его ацетильного аддукта), для AMDIS.

Судебная медицина - Прикрепленный файл  Drugs1806.rar ( 7.22 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1191
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Zordrak
сообщение 11.01.2009 - 21:44
Сообщение #6


Участник форума

Группа: Участники
Регистрация: 26.05.2008
Пользователь №: 8 611


Вашему вниманию представляем демо-версию библиотеки масс-спектров для AMDIS. В ней содержится более 200 спектров. Данный вариант распространяется свободно. Скачать .
Будем признательны за выявленные ошибки и замечания. Замечания можно оставлять здесь.

Полный вариант предлагаемой демо-библиотеки содержит абсолютные времена удерживания. Есть так же методика по установке ГХ метода с получением шкалы времён удерживания на колонках нескольких типов.

Существует расширенный вариант библиотеки содержащий около 600 спектров (400 соединений с временами удерживания). Обновление и пополнение библиотеки происходит постоянно.

____________
Предупреждение: незначительное нарушение [*]
Выдал: Дмитрий
Причина: Нарушение пп. 5.5, 7.8.1 правил форума.
Истекает: через 1 день
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
bell
сообщение 5.02.2009 - 12:54
Сообщение #7


Вновь прибывший

Группа: Участники
Регистрация: 5.02.2009
Пользователь №: 12 609


Здравствуйте коллеги.Подскажите где можно скачать amdis и еще много разных поисковиков.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 5.02.2009 - 13:58
Сообщение #8


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(bell @ 5.02.2009 - 14:54)
Здравствуйте коллеги.Подскажите где можно скачать amdis и еще много разных поисковиков.


http://www.amdis.net
http://chemdata.nist.gov/
http://chemdata.nist.gov/mass-spc/amdis/
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 25.03.2009 - 09:05
Сообщение #9


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Agilent анонсировал новую базу данных для судебной токсикологии
http://www.interlab.ru/news/read.php?id=104
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 25.11.2009 - 19:07
Сообщение #10


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Для АМДИС масс-спектры нескольких каннабимиметиков…
Масс-спектры JWH-018 и JWH-073.
А так же масс-спектры гомолога С8 соединения СР-47,497 и его производных (диацетил- и диТМС-).



Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Cannabimimetics.rar ( 1.73 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1080
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
макsим
сообщение 26.11.2009 - 18:03
Сообщение #11


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 1.04.2009
Пользователь №: 13 808


Спасибо коллеги!!! Только подскажите как этим воспользоваться?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 26.11.2009 - 20:00
Сообщение #12


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Распаковываете архив в директории Lib проги AMDIS.
Запускаете AMDIS, заходите в меню Library, выбираете подменю Library Transfer. В появившемся окне выбираем кнопку Files, в открывшейся панели с левой стороны жмём Load library, выбираем библиотеку с каннабимиметиками, затем в правой части жмем кнопку с тем же названием и выбираем библиотеку, которую пользуете в обиходе. Жмем Close. В правой части окна выбираем компонент и жмем Transfer. Всё, компонент добавлен в Вашу поисковую библиотеку масс-спектров. smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 27.12.2009 - 10:32
Сообщение #13


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Масс-спектр нового синтетика 4-метоксифенциклидина (пара-метокси-РСР). Индекс удерживания на колонке НР-5MS - 2212. При ГХ анализе так же свойственен продукт термолиза (он общий для пара-метокси-РСР и трамадола).



Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  pMeOPCP.rar ( 863 байт ) Кол-во скачиваний:  831
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 15.02.2010 - 20:03
Сообщение #14


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Реальные масс-спектры и индексы удерживания СР-47,497-С8 (для колонки HP-5MS) и его производных (диацетил-, дипентафторпропионил-, монометил-, дитрифторацетат-, дитриметилсилил-).
Наибольшую чувствительность дают ТМС производные (изомеры выходят одним пиком), хуже всего метильные производные (пик слегка уширен).
Как обычно для АМДИС...
Внес поправку в название метильного производного, СР-47,497-С8 даёт в основном монометильное производное (спектры которых приведены в базе для обоих изомеров, исправление коснулось лишь названия производных).

Сообщение отредактировал KSS17 - 20.02.2010 - 09:32


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Cannabimimrial.rar ( 5.3 килобайт ) Кол-во скачиваний:  730
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
макsим
сообщение 16.02.2010 - 20:12
Сообщение #15


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 1.04.2009
Пользователь №: 13 808


Цитата(KSS17 @ 15.02.2010 - 20:03)
Здравствуйте!
Реальные масс-спектры и индексы удерживания СР-47,497-С8 (для колонки HP-5MS) и его производных (диацетил-, дипентафторпропионил-, диметил-, дитрифторацетат-, дитриметилсилил-).
Наибольшую чувствительность дают ТМС производные (изомеры выходят одним пиком), хуже всего метильные производные (пик слегка уширен).
Как обычно для АМДИС...


Уважаемый KSS это вы из биопроб или из травы или просто литературные данные привели?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

38 страниц V  1 2 3 > » 



- Обратная связь Сейчас: 26.05.2017 - 12:20

Designed by Fisana  2006