Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
38 страниц V < 1 2 3 4 5 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

SUDMED_2344_AMDISLIB_20170101.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

SUDMED_2344_NISTLIB_20170101.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED_2344_ACSLIB_20170101.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

SUDMED_2344_MSHUNLIB_20170101.mslibrary.xml - библиотека в формате Agilent MassHunter

SUDMED_2344_20170101.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED_2344_LIB_20170101_NEW.pdf - сведения об обновлениях

ReadMe.txt - инструкция по установке библиотек SUDMED

Сообщение отредактировал KSS17 - 2.01.2017 - 08:33


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  2699
Судебная медицина - Прикрепленный файл  ReadMe.txt ( 1.82 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1619
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_MSHUNLIB_20170101.zip ( 849.75 килобайт ) Кол-во скачиваний:  167
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_ACSLIB_20170101.L.zip ( 907.86 килобайт ) Кол-во скачиваний:  165
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_LIB_20170101.pdf ( 804.52 килобайт ) Кол-во скачиваний:  265
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_2344_LIB_20170101_NEW.pdf ( 9.56 килобайт ) Кол-во скачиваний:  234
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_AMDISLIB_20170101.zip ( 877.32 килобайт ) Кол-во скачиваний:  200
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_2344_NISTLIB_20170101.zip ( 1.72 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  228
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 13.11.2010 - 14:01
Сообщение #31


Мастер I

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(xumuk @ 13.11.2010 - 13:57)


А есть у кого-нибудь полный перевод на русский инструкции к программе AMDIS?


На сайте Хроматэка
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 16.11.2010 - 10:38
Сообщение #32


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


На сайте Хроматека только краткая инструкция, без подробных объяснений. В установочном комплекте программы AMDIS есть еще полная инструкция на английском (228 страниц), где подробно расписывается вся программа и все ее возможности. Вот про эту то инструкцию я и спрашивал.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 17.11.2010 - 19:34
Сообщение #33


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Возможное решение проблем с прочтением АМДИСом файлов разных форматов освещено на сайте химиков-аналитиков:


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  AMDIS______________________.txt ( 5.62 килобайт ) Кол-во скачиваний:  815
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Eugen
сообщение 20.11.2010 - 01:07
Сообщение #34


Вновь прибывший

Группа: Пользователи
Регистрация: 20.11.2010
Пользователь №: 24 145


Цитата(KNIISE @ 10.11.2010 - 19:26)

Может кто и не знает: Канадские токсикологи выкладывают в НР-формате библиотеку наркоты и психотропов по адресу...


Спасибо за ссылку.
А существует ли способ эту библиотеку сконвертировать во что-то, что nist mssearch умеет смотреть? Как эту библиотеку можно посмотреть, если не в привязке к кемстейшн?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 22.11.2010 - 10:32
Сообщение #35


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(Eugen @ 20.11.2010 - 00:07)
...
А существует ли способ эту библиотеку сконвертировать во что-то, что nist mssearch умеет смотреть? Как эту библиотеку можно посмотреть, если не в привязке к кемстейшн?

К АМДИСу в комплекте идет конвертер библиотек.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 10.12.2010 - 07:15
Сообщение #36


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


У меня есть библиотека в формате .L, но конвертировать ее в формат .MSP или MSSearch с помощью указанного конвертера не возможно, так как в ней слишком много спектров (больше 65 тысяч). С помощью какой программы можно посмотреть эту библиотеку, и вытащить из нее нужные спектры.

P.S. Просматриваю список НС на предмет наличия спектров в базах приборов и не могу найти таковых для многих соединений, например (из самого начала), альфамепродин, альфаметилтиофентанил и др. Есть ли у кого-нибудь библиотека спектров всех НС, ПВ, прекурсоров, СДВ и ЯВ (которые вообще можно проанализировать на ХМС)? Может быть есть смысл составить такую библиотеку?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 10.12.2010 - 11:55
Сообщение #37


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(xumuk @ 10.12.2010 - 06:15)
У меня есть библиотека в формате .L, но конвертировать ее в формат .MSP или MSSearch с помощью указанного конвертера не возможно, так как в ней слишком много спектров (больше 65 тысяч). С помощью какой программы можно посмотреть эту библиотеку, и вытащить из нее нужные спектры..


Аджилентовская МС-оболочка Хемстейшен.

Цитата(xumuk @ 10.12.2010 - 06:15)
.. Есть ли у кого-нибудь библиотека спектров всех НС, ПВ, прекурсоров, СДВ и ЯВ (которые вообще можно проанализировать на ХМС)? Может быть есть смысл составить такую библиотеку?


_http://www.police-russia.ru/showthread.php?t=20196&page=18
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 10.12.2010 - 17:41
Сообщение #38


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 10.12.2010 - 18:08
Сообщение #39


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(Anthony_Hunter @ 10.12.2010 - 17:41)
Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...

Масс-спектр нафирона где-то приводился на форуме месяца 2 назад. Поищите поиском. Он не образует TFA производных, как и МДПВ. Его спектр остается неизменным при любых дериватизациях.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 11.12.2010 - 21:05
Сообщение #40


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(Anthony_Hunter @ 10.12.2010 - 17:41)
Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...

Прошу прощения. Сразу сам не нашел спектр на форуме. Вот сслылка:
http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=1...mp;hl=naphyrone
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 12.12.2010 - 10:44
Сообщение #41


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Цитата(A58 @ 11.12.2010 - 22:05)
Прошу прощения. Сразу сам не нашел спектр на форуме. Вот сслылка:
http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=1...mp;hl=naphyrone


Спасибо! Нашел.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
brainless
сообщение 12.12.2010 - 11:56
Сообщение #42


Участник форума

Группа: Участники
Регистрация: 6.08.2009
Пользователь №: 16 087


Цитата(Anthony_Hunter @ 12.12.2010 - 10:44)
Нашел.

Посмотрите ещё вот здесь. Нафирон там есть, правда без ТФА-дериватов.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 13.12.2010 - 18:31
Сообщение #43


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Цитата(brainless @ 12.12.2010 - 12:56)
Посмотрите ещё вот здесь. Нафирон там есть, правда без ТФА-дериватов.


Спасибо, но что-то по ссылке не получилось перейти...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
brainless
сообщение 13.12.2010 - 20:21
Сообщение #44


Участник форума

Группа: Участники
Регистрация: 6.08.2009
Пользователь №: 16 087


Anthony_Hunter,
Они там на полис-раша.ру вчера активно обсуждали события на Манежке.
После этого (совпадение или случайность, не знаю), до сайта стало не достучаться.
Если эта библиотека Вам нужна, напишите в личку, куда её скинуть.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 23.12.2010 - 16:15
Сообщение #45


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Всех приветствую!
Хочу заняться положительной хим.ионизацией дизайнерских. Насколько я понял: использование метана будет давать до 3 молекулярных ионов - очевидно, хорошо для надежной идентификации, но сильная фрагментация - плохо для малых концентраций; использование изобутана будет давать 1 молекулярный ион при большей "удельной" интенсивности всех ионов. Плюс: как-то будут сказываться неизбежные примеси в газе-реагенте. Прошу совета и рекомендаций, какой реагентный газ выбрать - метан или изобутан?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

38 страниц V < 1 2 3 4 5 > » 



- Обратная связь Сейчас: 23.03.2017 - 15:21

Designed by Fisana  2006