Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V < 1 2 3 4 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  3981
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  906
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  703
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  585
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  496
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  563
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  517
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  615
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  714
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
KSS17
сообщение 17.02.2010 - 21:40
Сообщение #16


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Конечно извлечения из курительной смеси...
Но для СР есть шанс и в моче его отловить, он должен образовывать конъюгаты.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
sudmed2007
сообщение 18.02.2010 - 14:42
Сообщение #17


Опытный участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.02.2008
Из: Карелия
Пользователь №: 7 412


Уважаемый KSS17!
По просьбе наших химиков. Вы не могли бы выложить масс-спектры для дериватов псилоцибина (MSTFA)? Данные масс-спектры отсутствуют в их AMDIS
Спасибо!

Сообщение отредактировал sudmed2007 - 18.02.2010 - 14:42
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 18.02.2010 - 21:53
Сообщение #18


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Вот как-то так для псилоцина...
Псилоцибин не летит, это термолабильное вещество smile.gif

Судебная медицина - Прикрепленный файл  PsiloTMS.rar ( 515 байт ) Кол-во скачиваний:  938
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 24.04.2010 - 19:22
Сообщение #19


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Ещё пару полезных спектров для АМДИС...
Галлюциногены по литературе.
Мефедрон, b-k-МBDB, MDPV вживую.
Прим.: для мефедрона и b-k-MBDB получать пентафторпропионовые производные не айс, стерика мешает...

Судебная медицина - Прикрепленный файл  Synth.rar ( 2.11 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1161
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Hallucinigen.rar ( 2.35 килобайт ) Кол-во скачиваний:  907
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Ludens
сообщение 12.06.2010 - 19:03
Сообщение #20


Претендент

Группа: Участники
Регистрация: 19.10.2008
Пользователь №: 10 354


По курилкам.
1. Библиотека спектров-структур-индексов в формате NIST (Smoke.HP) и MSP (Smoke.MSP)
Индексы даны для режима: скорость 35С/мин до 300С, колонка EVDX-5ms (будет близко для HP-5ms).
2. MSP для наиболее значимых метаболитов JWH-018 и 073 в разных дерватах JWH-073-M и JWH-018-M.
Индексы даны для режима: скорость 60С/мин до 320С, колонка EVDX-5ms (будет близко для HP-5ms). Меньшие температуры не советую, т.к. удерживание солидно.


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Smoke_Lib.rar ( 78.69 килобайт ) Кол-во скачиваний:  805
Судебная медицина - Прикрепленный файл  JWH_M.rar ( 5.9 килобайт ) Кол-во скачиваний:  790
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Ludens
сообщение 31.07.2010 - 23:11
Сообщение #21


Претендент

Группа: Участники
Регистрация: 19.10.2008
Пользователь №: 10 354


Доброе время, коллеги. Здесь ГХ/МС - библиотека по практически важным метаболитам JWH-250, основной материал выложен на соответствующей ветке. Индексы приведены для режима 50°С (0.5 мин), 99°/мин (100°С, 1 мин), 35°/мин (300°С, 20 мин), колонка EVDX-5ms (подойдет и HP-5ms). Индексы для DB-17ms в материале. Поскольку эффективная доза для 250 выше, чем для JWH-018 (примерно в 2-3 раза), то (по крайней мере), его основной метаболит может быть обнаружен в свеженакуренной моче (и на не слишком убитой колонке) и без дериватизации. Тем не менее, лучше дериватизировать TMS, подойдет AC, но TFA противопоказан категорически.
Судебная медицина - Прикрепленный файл  _250.rar ( 2.02 килобайт ) Кол-во скачиваний:  804


Сообщение отредактировал Ludens - 31.07.2010 - 23:13
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 10.08.2010 - 11:29
Сообщение #22


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Предлагаю масс-спектры ацетилированных производных некоторых метаболитов мефедрона, так как пик самого мефедрона Ас иногда на хроматограммах очень маленький и не проходит идентификацию, а метаболиты всегда есть.
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Mephedrone_M.rar ( 1.29 килобайт ) Кол-во скачиваний:  872
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 2.09.2010 - 08:00
Сообщение #23


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Здравствуйте! У нас в экспертизах появились пиперазины. Выкладываю масс-спектры некоторых производных TFMPP (trifluoromethylphenylpiperazine) и его метаболитов.
Судебная медицина - Прикрепленный файл  TFMPP_M.rar ( 2 килобайт ) Кол-во скачиваний:  806
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Ludens
сообщение 12.10.2010 - 23:20
Сообщение #24


Претендент

Группа: Участники
Регистрация: 19.10.2008
Пользователь №: 10 354


Доброе время, коллеги. Выкладываю обновление библиотек по нативам курилок (пост #20, формат NIST - Smoke.HP и MSP - Smoke.MSP). Индексы для слабополярной фазы.
Комментарии к добавленному:
- JWH-210 сейчас активно продается индивидуально или в смесях.
- Salvinorin A нестабилен в растворах. В биожидкостях может быть определен нативом (по крайней мере, LC-MS/MS).
- DD-001 - "нестандартный" аминоалкилиндол. Обнаружен GCuber и выложен с его разрешения. Некоторые сомнения по структуре (свободный гидроксил) развеялись после попытки ацетилирования (не прошло). По всей видимости, именно это соединение найдено в травках и подтверждено встречным синтезом в Дублине [url=http://handbook.muh.ie/Toxicology/Head_Shop_ ID_Poster1_Aug2010.pdf]постер[/url], их обозначение я и использовал. Аффинность увы, не знаю..

Сообщение отредактировал FILIN - 13.10.2010 - 00:09


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Smoke_Lib.rar ( 82.94 килобайт ) Кол-во скачиваний:  714
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 1.11.2010 - 10:11
Сообщение #25


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Всех приветствую!
Предлагаю масс-спектры дизайнерских амфетаминов прописывать при малой энергии ионизации: 10 эВ.
Полагаю, это позволит различать их по масс-спектрам, как в случае хим.ионизации, которой у многих нет.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 1.11.2010 - 16:38
Сообщение #26


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(KNIISE @ 1.11.2010 - 10:11)
Всех приветствую!
Предлагаю масс-спектры дизайнерских амфетаминов прописывать при малой энергии ионизации: 10 эВ.
Полагаю, это позволит различать их по масс-спектрам, как в случае хим.ионизации, которой у многих нет.

Здоравствуйте! Не все так просто. Я пробовал снимать спектры некоторых аминов, у которых молекулярный ион очень мал (менее 1%) при ЕИ 30,20 10 эВ. спектры несколько изменились по интенсивностям ионов, сами интенсивности уменьшаются при уменьшении ЕИ, однако молекулярные ионы так и не достигли заметной величины. Однако я не пробовал на мефедроне и его аналогах, может быть у Вас получится. Удачи.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 1.11.2010 - 16:47
Сообщение #27


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Всё так...
Если у соединения нет молекулярного ион-радикала, то и не получите в спектре ничего.
Если он мал, то больше он не станет, то есть такой подход будет в ущерб чувствительности к данному соединению.
Аналогично эксперементировал на веществе не образующем молекулярного ион-радикала, результат - "болт железный"...
Только один подход оптимален, как я думаю, если соединение дериватизируется, надо получать его производные. Это справедливо для аналитической и судебной токсикологии, а так же для криминалистов...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 3.11.2010 - 10:39
Сообщение #28


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(A58 @ 1.11.2010 - 15:38)
... Я пробовал снимать спектры некоторых аминов, у которых молекулярный ион очень мал (менее 1%) при ЕИ 30,20 10 эВ. спектры несколько изменились по интенсивностям ионов, сами интенсивности уменьшаются при уменьшении ЕИ, однако молекулярные ионы так и не достигли заметной величины...

Цитата(KSS17 @ 1.11.2010 - 15:47)
...
Если у соединения нет молекулярного ион-радикала, то и не получите в спектре ничего.
Если он мал, то больше он не станет, то есть такой подход будет в ущерб чувствительности к данному соединению.
Аналогично эксперементировал на веществе не образующем молекулярного ион-радикала, результат - "болт железный"...

А жаль!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 10.11.2010 - 19:26
Сообщение #29


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Подарок от Dr. Till Beuerle, Technische Universitaet Braunschweig, Institut fuer Pharmazeutische Biologie, GERMANY: масс-спектры аналогов JWH-018 в NIST-формате (желающие получить в НР-формате или в ПДФе - обращайтесь к нему, мыло - в прилагаемом ПДФе).

Подарок от коллег - 41 спектр в НР-формате JWHей и дизайнерских:

Может кто и не знает: Канадские токсикологи выкладывают в НР-формате библиотеку наркоты и психотропов по адресу http://www.ualberta.ca/~gjones/mslib.htm

А по немцы дают посмотреть структурные формулы и масс-спектры (на картинках гнусного качества) дизайнерских по адресу http://www.designer-drugs.de/ , http://www.designer-drugs.eu/

Всем удачи!


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Structural_Analogues_JWH_018.zip ( 54.44 килобайт ) Кол-во скачиваний:  666
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Structural_Analogues_JWH_018.pdf ( 239.95 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1296
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Gekc.zip ( 68.09 килобайт ) Кол-во скачиваний:  662
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 13.11.2010 - 11:57
Сообщение #30


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


К сожалению на указанных сайтах без покупки программы можно посмотреть только структурную формулу, а "картинка гнусного качества" всегда одна и та же.

А есть у кого-нибудь полный перевод на русский инструкции к программе AMDIS?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V < 1 2 3 4 > » 



- Обратная связь Сейчас: 25.04.2024 - 05:32