помогите разобраться в возможных причинах смерти

умер молодой человек. дома. в ванной. нашли его сидящим в ванной, колени согнуты, руки на коленях, голова лежала на руках, лицо было наполовину в воде (нос, рот, до ушей). на той части лица, которая была в воде были фиолетовые пятна. на остальном теле (кроме руки) пятен не было, хотя оно также находилось в воде. в руке был зажат шприц. (тело было еще теплое. в ванной он пробыл 1,5 часа) приехавшие медики следов укола не обнаружили. тело переложили из ванной на пол. через несколько часов пятна исчезли и он лежал как живой, только пошли кровавые выделения из носа. в справке о смерти написали: внезапная сердечная смерть.
хотелось бы узнать реальную причину смерти. (захлебнулся, потерял сознание, остановка сердца, остановка дыхания или что-то еще)

Вам лучше обратиться в то же самое экспертное учреждение после завершения всех дополнительных исследований (примерно через 1мес.) и очень вежливо поинтересоваться - какая же окончательная причина смерти.

а что за дополнительные обследования?
и делают ли трепанацию черепа при передозировке?

Дополнительные исследования - судебно-химическое (анализы на наличие различных отравляющих веществ в крови и моче от трупа); судебно-гистологическое (микроскопическое исследование тонких срезов тканей внутренних органов трупа), возможно и другие.
Второй вопрос мне не совсем понятен. Что Вы имеете в виду?

всегда ли делается трепанация при вскрытии?

Вы, вероятно, имели в виду - делают ли распил черепа. Трепанация - иное.
Да, распиливание черепа при исследовании любого трупа обязательно.

а как определяют умер ли человек от передозировки или остановилось сердце? или дыхание? или потерял сознание и захлебнулся? с учетом того, что наркотики в крови присутствуют

Я уже написал - что Вам следует сделать, если хотите узнать причину смерти.
Читать лекцию по клинической токсикологии на этом сайте никто не будет.