1- или 8-канальный секвенатор?



Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Судебно-медицинская генетика
Lady
Здравствуйте коллеги-генетики! Очень нужна ваша помощь. Помогите, пожалуйста, определиться с выбором. В чем разница между 1- и 8-канальными секвенаторами? Есть ли между ними существенные различия? Сколько объектов (включая Кв) позволяют исследовать данные приборы за раз? Есть ли разница по продолжительности работы? Сильно ли различается их техническое обслуживание в материальном плане? И если у вас была бы возможность выбора, какой бы заказали при ПОКА малых, но ПОСТЕПЕННО увеличивающихся, объемах работы? Причем возможность замены будет скорее всего очень-очень нескоро либо ее не будет вовсе.


Зубр
Доброго времени суток уважаемая 'Lady'!
Цитата(Lady @ 19.05.2012 - 16:08)

... В чем разница между 1- и 8-канальными секвенаторами? Есть ли между ними существенные различия? Сколько объектов (включая Кв) позволяют исследовать данные приборы за раз? Есть ли разница по продолжительности работы?...

Принцип работы подобен, но один капилляр одномоментно может анализировать одну пробу и это 30 минут. Чтобы сделать мало-мальски достойные выводы при анализе одной пробы, надо проанализировать в одном сете (проекте) аллельный леддер, положительный контроль, отрицательный контроль и Кв. Вот уже 2.5-3 часа работы прибора. Восьмикапиллярный за те же 30 минут проанализирует восемь разных проб.
Цитата
...Сильно ли различается их техническое обслуживание в материальном плане? И если у вас была бы возможность выбора, какой бы заказали при ПОКА малых, но ПОСТЕПЕННО увеличивающихся, объемах работы? Причем возможность замены будет скорее всего очень-очень нескоро либо ее не будет вовсе.

В материальном плане - восьмикапиллярный прибор более затратный, однако не на столько, чтобы эллиминировать преимущества. Для любого из приборов необходимо "выбить" рабочий лимит реагентов и компектующих, иначе Ваша работа будет связана с массой затраченных нервов.
Удачи.


Lady
Большое спасибо за разъяснения, многоуважаемый Зубр.
А можно ли использовать не все капилляры? Допустим запустить часть или запустить все, но без реагентов?


profgenik9a
Цитата(Lady @ 22.05.2012 - 19:00)
Большое спасибо за разъяснения, многоуважаемый Зубр.
А можно ли использовать не все капилляры? Допустим запустить часть или запустить все, но без реагентов?


Если хотите "убить" приборчик, то можно и воздух пустить по капиллярам rotate.gif
А чем Вас не устраивает 4-х канальный ? за те же 30 мин. леддер и 3 пробы (как вариант мама, папа и ребенок оцениваются сразу). Для СРЕДНИХ объемов то, что доктор прописал smile.gif


Lady
Цитата(profgenik9a @ 23.05.2012 - 20:24)

А чем Вас не устраивает 4-х канальный ?


Не все зависит только от моего желания sad.gif Имеем возможность выбирать только из двух вариантов


profgenik9a
Цитата(Lady @ 23.05.2012 - 22:09)
Не все зависит только от моего желания sad.gif Имеем возможность выбирать только из двух вариантов


Тогда конечно 8-ка лучше. В "пустые" (без пробы, К-лей, Ladd.) лунки загоняем только Form. и ....поехали.


Lady
Цитата(profgenik9a @ 25.05.2012 - 17:21)
В "пустые" (без пробы, К-лей, Ladd) лунки загоняем только Form.

Не поняла. "Form." - это что?

И еще возник вопросик. Не отразится ли отрицательно на приборе, если он не будет эксплуатироваться каждый день?


Зубр
Уважаемая 'Lady'!
Цитата(Lady @ 25.05.2012 - 19:50)
Не поняла. "Form." - это что?

И еще возник вопросик. Не отразится ли отрицательно на приборе, если он не будет эксплуатироваться каждый день?

Form - это сокращение от Formamid. Используется фрормамид высокой степени очистки, в нём же растворяются все пробы для последующего капиллярного электрофореза. Вообще-то, при мало-мальской загрузке работой всегда можно будет набрать проб на 8 дорожек. Пустые лунки могут быть заполнены буфером, а не дорогим формамидом.
Что касается второго Вашего вопроса, то - не отразится. Подробнее читайте инструкции к прибору - там очень подробно расписано, что делать если прибор остановлен на неделю, две, месяц, и как его консервировать deal1.gif .
Удачи.


Gordiz
Цитата(Lady @ 19.05.2012 - 16:08)
В чем разница между 1- и 8-канальными секвенаторами?

Я бы уточнил производителя и модели приборов. Например, если Вам предлагают 8-ми капиллярный Beckman CEQ 8000 - брать не стоит. Если выбор между ABI 310 и ABI 3500, нужно брать 3500, не смотря на то, что эксплуатация обойдется на порядок дороже.


Пыхтачок
У нас в лаборатории 3500 (8 канальный) очень даже довольны, в обслуживание есть маленькие ньюансики, но думаем они решатся smile.gif


Русская версия Invision Power Board © 2001-2017 Invision Power Services, Inc.

© 2002-2015 Форум судебных медиков
При копировании материалов сайта размещение активной ссылки на источник обязательно!