[prostochock]

Здравствуйте!
При определении родства братьев и сестер возможны случаи, когда общих аллелей в исследованных локусах может и не быть. Имеется ли смысл проводить типирование по Y хромосоме (в случае братьев) для установления родства по мужской линии? Если да, то каким образом проводить стат. обработку? Если типирование по Y хромосоме дает факт, что они принадлежат к различным линиям, то имеет ли смысл использовать для дальнейшего исследования наборы по X хромосоме (опять же таки беру в расчет только братьев)? Ничего не спрашиваю про митохондриальную ДНК, т.к с этой техникой на практике не знаком.

[prostochock]

Вот сейчас случай, что по 28 аутосомным локусам получились братья. Однако, в наборе Globalfiler, на наше счастье имеется дополнительный локус с Y хромосомы, по которому они разошлись. Тут то мы и решили проверить их по мужской линии. Они разошлись. Теперь ломаю голову, толи у них мать одна, толи вообще не родственники. Как считать вообще разобраться теперь не могу, т.к все алгоритмы, известные мне построены на гипотезе априорной гипотетической родительской пары.

[genosys]

Вот сейчас случай, что по 28 аутосомным локусам получились братья. Однако, в наборе Globalfiler, на наше счастье имеется дополнительный локус с Y хромосомы, по которому они разошлись. Тут то мы и решили проверить их по мужской линии. Они разошлись. Теперь ломаю голову, толи у них мать одна, толи вообще не родственники. Как считать вообще разобраться теперь не могу, т.к все алгоритмы, известные мне построены на гипотезе априорной гипотетической родительской пары.

Ну сразу бы и начинали с конкретики. Пока вам считать ничего и не надо, надо разобраться с родством по матери. Отцы очевидно разные, если Вы достаточно Y-STR'ов проанализировали и не из быстро мутирующих. Собс-но, совет тот же - больше маркеров! Желательно X-STR, вроде есть готовые наборы на 20 локусов.

Так вот по 28 локусам оказалось достаточно (категоричный вывод), чтобы сделать ложноположительный вывод...по 40-60 локусам вероятность будет еще больше, следовательно вероятность ложноположительного решения выше.

В этом случае никаких категоричных выводов быть не может, они всегда вероятностные. И с сиблингами степень определенности обычно меньше, чем с детьми-родителями.

[prostochock]

Ну сразу бы и начинали с конкретики. Пока вам считать ничего и не надо, надо разобраться с родством по матери. Отцы очевидно разные, если Вы достаточно Y-STR'ов проанализировали и не из быстро мутирующих. Собс-но, совет тот же - больше маркеров! Желательно X-STR, вроде есть готовые наборы на 20 локусов.
В этом случае никаких категоричных выводов быть не может, они всегда вероятностные. И с сиблингами степень определенности обычно меньше, чем с детьми-родителями.

Категорично, да, это я не корректно выразился, приношу извинения.
Поставили набор на 16 Y-локусов. Как считать полученные данные совершенно не представляю, т.к. Весь принцип общета строится на факте неспеленого наследования. Тут как Вы понимаете этот исключается. Первый раз столкнулся с подобной ситуацией и как правильно поступить совершенно не представляю