Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
Предпики (статеры) в капиллярном электрофорезе |
ExpGen |
18.12.2014 - 22:37
Сообщение
#1 |
Вновь прибывший Группа: Участники Регистрация: 10.11.2014 Пользователь №: 40 711 |
Товарищи эксперты, объясните пожалуйста откуда (почему) возникают предпики (статеры) в капиллярном эклектрофорезе (точнее при амплификации).Всем добра!
|
Razum72 |
19.12.2014 - 11:51
Сообщение
#2 |
Участник форума Группа: СМЭ Регистрация: 9.08.2009 Пользователь №: 16 133 |
Здравствуйте, уважаемые коллеги!
ExpGen, судя по никнейму Вы эксперт, поэтому поймете объяснение. Статер («предпик») – это «ложный» пик, меньше истинного на один повтор (бывает больше на один повтор, бывает и не на один, но это крайне редкие случаи). Точного обоснования их появления нет, но есть гипотезы, одна из которых: полимераза, синтезируя комплементарную нить, не отрываясь от матрицы может присоединить около 60 нуклеотидов, затем она отсоединяется и присоединяется вновь (та же или другая молекула), получается, что какое-то мгновение матрица и синтезирующаяся нить находятся без фермента и они немного плавятся («дышат»), а затем «ошибочно» схлопываются при этом пропуская один повтор, затем этот «побочный» продукт накапливается, вероятность возникновения этой ошибки «специфична» для каждого локуса, т.к. зависит от нуклеотидного состава и от количества тандемных повторов. Смотрите рисунок во вкладке. Ди- и тринуклеотидные повторы дают очень высокие статеры, поэтому в идентификации в основном стараются использовать тетра. Всего доброго! Эскизы прикрепленных изображений |
Сейчас: 3.05.2024 - 01:09 |