[alexlp]

Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35

[KSS17]

Здравствуйте!
Масс-спектры маркеров РВ-22, РВ-22F, AB-PINACA, BB-22, AB-FUBINACA.
Под АМДИС, индексы для НР-5.
Отдельное спасибо за спектры коллегам marko и Korvet'у.

[KSS17]

Здравствуйте!
Метаболиты AB-PINACA, определяющиеся в моче. Производные метильные, триметилсилильные и смешанные эфиры. Библиотека под АМДИС, колонка НР-5. На рисунке нумерация метаболитов соответствует нумерации в библиотеке. Исправлена ошибка в индексе удерживания ТМС метаболита М1.

[Гермиона]

Доброго времени суток, коллеги!

Начала собирать разрозненные отдельные данные по современным дизайнерским психоактивным соединениям в одну "для работы" библиотеку - при помощи AMDIS.
Обнаружила, что AMDIS открывает файлы с расширениями .msp или .msl. Хотелось бы понять - в чем разница и как сделать такую "свою для работы" библиотеку читабельной для NISTsearch.

[KSS17]

Здравствуйте!
В чем разница не знаю... На любителя. В мсл два отдельных окна для редактирования, в мсп одно окно. Большенство народа пользует мсп.
Конвертация мсп и мсл в формат НИСТ не проблема, используйте Convert MS Libraris. Это программа находится в папке MSSEARCH, файл называется LIB2NIST.EXE. Позволяет конвертировать библиотеки НР и НИСТ под АМДИС, и мсп, мсл в НИСТ.

[Гермиона]

Здравствуйте, KSS17!
Искренне благодарю за разъяснение!
Попробую сейчас конвертировать "свою для работы" библиотеку для NIST. Будет удобнее для анализа тех образцов, где известно, что искать. Чтобы не "выскакивало" много лишнего, особенно соэкстрактивных соединений естественно присутствующих в биологических жидкостях.

[Chimik]

Здраствуйте)))
Подскажите, ГХ-МС Аджилент выдал вещество изониазид артифакт, да и заметил многие вещества выдает с этой приставкой. Это так "забиты" нативные вещества?

[KSS17]

Здравствуйте!

Здраствуйте)))
Подскажите, ГХ-МС Аджилент выдал вещество изониазид артифакт, да и заметил многие вещества выдает с этой приставкой. Это так "забиты" нативные вещества?

Несовсем так.
Артефакты это, как правило, продукты дегидротации, термолиза или внутримолекулярной циклизации.

[Chimik]

Спасибо, KSS17!
Как понимаю, например, при гидролизе происходят некие превращения вещества, а возможно ли посмотреть на формулу конкретного артефакта?

[KSS17]

Здравствуйте!

Статья и Бог Вам в помощь...

[Гермиона]

Здравствуйте, уважаемые коллеги!
Подскажите, пожалуйста, чем отличаются библиотечные папки с расширениями __.L и __.HP?

[Sergei4]

Здравствуйте
.L это под Chemstation (PBM search) (распологаются в как правило в директории С:/Database/
.HP под NJIS MS Search располлогаются в директории С:/NIST/MSSEARCH/
Посмотрите видео №4 по ссылке

[Chimik]

Спасибо, Уважаемый KSS 17!!!!
Хорошая статья, еще раз спасибо за консультейшн)))

[Гермиона]

Здравствуйте
.L это под Chemstation (PBM search) (распологаются в как правило в директории С:/Database/
.HP под NJIS MS Search располлогаются в директории С:/NIST/MSSEARCH/
Посмотрите видео №4 по ссылке

Здравствуйте, Sergei4!
Благодарю за ответ!
Наконец-то начинаю понимать, почему куча библиотек в разных папках с одинаковыми названиями но разными расширениями. Получается, что мало "собрать" библиотеку в АМДИС, чтобы удобно было работать, надо её конвертировать под Chemstation и NIST.
И, соответственно, включить библиотеку в настройки поисковиков.

[KSS17]

Здравствуйте!
Масс-спектры маркеров: AB-FUBINACA (метил-), AB-CHMINACA (метил-, ТМС-, бис-ТМС-), 5F-AB-PINACA (метил-, ТМС-, бис-ТМС-), FUB-PB-22 (метил).
Под АМДИС, индексы для НР-5.

Сообщение отредактировал KSS17 - 13.10.2013 - 13:26

[alexlp]

Собрал вместе все кастомные библиотеки, выложенные коллегами в этой ветке. Было бы полезно, пришпилить в топ этот файлик и обновлять его по мере загрузки сюда новых баз.

Сообщение отредактировал alexlp - 13.10.2013 - 12:25