![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() ![]() |
![]() |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
![]() |
| alexlp |
16.06.2008 - 21:41
Сообщение
#1 (закреплено) |
|
|
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы
SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 4129
SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт )
Кол-во скачиваний: 1171
sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт )
Кол-во скачиваний: 925
sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 696
SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 615
sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 668
sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 633
sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт )
Кол-во скачиваний: 1029
sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт )
Кол-во скачиваний: 1027 |
![]() |
![]() |
![]() |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
![]() |
| alexlp |
22.10.2013 - 06:24
Сообщение
#176 |
|
|
+пентафторпропионовые производные BP-22, PB-22F и BB-22 от Anthony_Hunter
Прикрепленные файлы
AMDISLIB_20131022.zip ( 2.51 мегабайт )
Кол-во скачиваний: 281
SUDMED_723_AMDISLIB_20131022.zip ( 491.86 килобайт )
Кол-во скачиваний: 275 |
![]() |
![]() |
| A58 |
22.10.2013 - 08:00
Сообщение
#177 |
|
|
Здравствуйте, коллеги. Вот, если интересно, выкладываю библиотеку под АМДИС. В ней пентафторпропионовые производные BP-22, PB-22F и BB-22. Скоро добавлю AB-PINACA, AB-FUBINACA и FUB-PB-22. Т.е. пробоподготовка проводилась точно как на THC-COOH в пентафторпропионовых производных. Здравствуйте Anthony_Hunter. Может все-таки пентафторпропиловые производные продукта гидролиза PB. А не пентафторпропионовые? Разница есть и существенная. |
![]() |
![]() |
| Гермиона |
22.10.2013 - 13:14
Сообщение
#178 |
|
|
Все кастомные библиотеки внутри архива освобождены от оболочек zip-rar, все аджилентовые и нистовые библиотеки конвертированы в MSP. Объединенная библиотека собрана заново: частично удалены дубликаты разных версий одних и тех же библиотек и дополнено из вновь добавленных и вновь конвертированных. Всего получилось 720 спектров. Здравствуйте, alexlp! Не нахожу aPVP в объединенной библиотеке. Это соединение отсутствует? Или оно под другим названием? Если есть необходимость, могу предложить фрагмент из имеющейся у нас библиотеки масс-спектров для АМДИС. Прикрепленные файлы
PVP.rar ( 855 байт )
Кол-во скачиваний: 280 |
![]() |
![]() |
| Anthony_Hunter |
23.10.2013 - 18:52
Сообщение
#179 |
|
|
|
![]() |
![]() |
| alexlp |
24.10.2013 - 07:43
Сообщение
#180 |
|
|
Т.е. пробоподготовка проводилась точно как на THC-COOH в пентафторпропионовых производных. Здравствуйте Anthony_Hunter. Может все-таки пентафторпропиловые производные продукта гидролиза PB. Уважаемый Anthony_Hunter! Что Вы подразумевали под пробоподготовкой? Только дериватизацию нативных соединений, или же щелочной гидолиз, экстракцию и затем дериватизацию продуктов гидролиза? |
![]() |
![]() |
| A58 |
24.10.2013 - 08:57
Сообщение
#181 |
|
|
Уважаемый Anthony_Hunter! Что Вы подразумевали под пробоподготовкой? Только дериватизацию нативных соединений, или же щелочной гидолиз, экстракцию и затем дериватизацию продуктов гидролиза? Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter. |
![]() |
![]() |
| Korvet |
25.10.2013 - 10:52
Сообщение
#182 |
|
|
на 5,7 минуте вещество - Si производное 1-(4-фторбензил)-1H-индол-3-карбоновой кислоты - вероятного метаболита QCBL-BZ-F (8-оксихинолиновой фубинаки).
Получено из нативного вещества |
![]() |
![]() |
| A58 |
28.10.2013 - 14:08
Сообщение
#183 |
|
|
[quote name='alexlp' date='16.06.2008 - 21:41' post='56355']Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Здравствуйте коллеги. Выкладываю производные (Ас, PrO,TFA,PFP) для некоторых стимуляторов, предлагаемых на известных сайтах. С индексами удерживания для НР-5.
A58_25X_NBOMe_AMDISLIB_20131028.zip ( 10.93 килобайт )
Кол-во скачиваний: 377 |
![]() |
![]() |
| Anthony_Hunter |
29.10.2013 - 17:08
Сообщение
#184 |
|
|
Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter. Здравствуйте коллеги. Я подразумевал щелочной гидголиз, а за тем дериватизацию в PFP. Если не делать щелочной гидролиз, то вы вряд ли сможете обнаружить малые концентрации и AB-PINACA и AB-FUBINACA. Хотя я могу и ошибаться... я не химик. Через пару дней выложу библиотеку с PFP производными этих соединений, а еще и с AB-PINACA-F и FUB-PB-22. |
![]() |
![]() |
| Anthony_Hunter |
29.10.2013 - 17:23
Сообщение
#185 |
|
|
Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter. Еще раз здравствуйте! Извиняюсь, сколько стоит "залить" смесью пентафторпроионового ангидрида с пентафторпропанолом пробу, чтобы не делать щелочной гидролиз? |
![]() |
![]() |
| KSS17 |
29.10.2013 - 17:49
Сообщение
#186 |
|
|
|
![]() |
![]() |
| alexlp |
30.10.2013 - 06:43
Сообщение
#187 |
|
|
Уважаемые Коллеги!
Предлагаю обсудить используемые условия хроматографирования и регистрации спектров. С целью оптимизации и унификации. Например (форма представления обсуждаема): Колонка HP5MS 30m x 0.25mm x 250um (с предколонкой) гн - гелий, постоянный поток. скорость примерно 36 см/сек (около 8 psi при начальной температуре). Поток устанавливается по ДИФЕНИЛАМИНУ с помощью RTL. RTdpa = 8.689 min. Программа: 65(1мин) -> 20 гр/мин -> 320(6.25мин) = 20 мин. Ввод: Pulsed Splitless Лайнер Single tapered, пустой, силанизированный (лайнеры моются и силанизируются). Температура инжектора 250 Pulsed Pressure 36.259 psi until 0.5 min Purge flow to Split Vent 50 ml/min at 1 min Septum purge(switched) 3 ml/min Gas saver 15 ml/min after 4 min Инжекция - автосамплер, стандартный ввод. Растворитель - этилацетат, изооктан. Промывки шприца до инжекции - 2 раза после - 5 раз Задержка на вязкость - 3 сек. Задержка на выход растворителя - 3.75 мин Интерфейс - 290 Источник 230 Квадруполь 150 Массы 42-700 Порог 150 Sample 2 EMV Mode - Gain Factor |
![]() |
![]() |
| Deminolog |
30.10.2013 - 08:24
Сообщение
#188 |
|
|
А не проще индексы удерживания взять? Тогда указывается колонка, газ-носитель да индекс удерживания. Величина все-таки относительная, а посему - достаточно воспроизводимая, как мне кажется. А уж от парафиновой свечки крупинку отколоть проблем не будет ни у кого. Главное, не напутать, где н-алканы, а где - изо.
|
![]() |
![]() |
| KSS17 |
30.10.2013 - 09:33
Сообщение
#189 |
|
|
Здравствуйте!
... А уж от парафиновой свечки крупинку отколоть проблем не будет ни у кого. Главное, не напутать, где н-алканы, а где - изо. Лучше брать аптечную вощенную бумажку, называется - капсулаторка... Там почти нет изо-форм. Помыть бумажку размером 1 на 1 см в 5 мл гексана и будет Вам счастье... |
![]() |
![]() |
| Deminolog |
30.10.2013 - 10:32
Сообщение
#190 |
|
|
Добрый день!
Спасибо за совет! Учту... |
![]() |
![]() |
![]() ![]() |
| Сейчас: 24.10.2025 - 21:05 |