Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 11 12 13 14 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4102
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1084
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  897
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  671
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  586
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  642
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  606
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  955
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  967
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 22.10.2013 - 06:24
Сообщение #176


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


+пентафторпропионовые производные BP-22, PB-22F и BB-22 от Anthony_Hunter


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  AMDISLIB_20131022.zip ( 2.51 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  274
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_723_AMDISLIB_20131022.zip ( 491.86 килобайт ) Кол-во скачиваний:  269
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 22.10.2013 - 08:00
Сообщение #177


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(Anthony_Hunter @ 21.10.2013 - 16:09)
Здравствуйте, коллеги.
Вот, если интересно, выкладываю библиотеку под АМДИС. В ней пентафторпропионовые производные BP-22, PB-22F и BB-22.
Скоро добавлю AB-PINACA, AB-FUBINACA и FUB-PB-22.
Т.е. пробоподготовка проводилась точно как на THC-COOH в пентафторпропионовых производных.


Здравствуйте Anthony_Hunter. Может все-таки пентафторпропиловые производные продукта гидролиза PB. А не пентафторпропионовые? Разница есть и существенная.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Гермиона
сообщение 22.10.2013 - 13:14
Сообщение #178


Авторитетный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 20.01.2011
Пользователь №: 25 109


Цитата(alexlp @ 16.10.2013 - 12:57)

Все кастомные библиотеки внутри архива освобождены от оболочек zip-rar, все аджилентовые и нистовые библиотеки конвертированы в MSP.
Объединенная библиотека собрана заново: частично удалены дубликаты разных версий одних и тех же библиотек и дополнено из вновь добавленных и вновь конвертированных.
Всего получилось 720 спектров.


Здравствуйте, alexlp!
Не нахожу aPVP в объединенной библиотеке.
Это соединение отсутствует? Или оно под другим названием?
Если есть необходимость, могу предложить фрагмент из имеющейся у нас библиотеки масс-спектров для АМДИС.

Сообщение отредактировал KSS17 - 22.10.2013 - 15:49


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  PVP.rar ( 855 байт ) Кол-во скачиваний:  270
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 23.10.2013 - 18:52
Сообщение #179


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Цитата(A58 @ 22.10.2013 - 09:00)
Здравствуйте Anthony_Hunter. Может все-таки пентафторпропиловые производные продукта гидролиза PB. А не пентафторпропионовые? Разница есть и существенная.

Сильно извиняюсь. Конечно пентафторпропионовые. Спасибо за замечание.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 24.10.2013 - 07:43
Сообщение #180


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Anthony_Hunter @ 21.10.2013 - 19:09)

Т.е. пробоподготовка проводилась точно как на THC-COOH в пентафторпропионовых производных.



Цитата(A58 @ 22.10.2013 - 11:00)
Здравствуйте Anthony_Hunter. Может все-таки пентафторпропиловые производные продукта гидролиза PB.


Уважаемый Anthony_Hunter!

Что Вы подразумевали под пробоподготовкой? Только дериватизацию нативных соединений, или же щелочной гидолиз, экстракцию и затем дериватизацию продуктов гидролиза?

Сообщение отредактировал alexlp - 24.10.2013 - 07:44
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 24.10.2013 - 08:57
Сообщение #181


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(alexlp @ 24.10.2013 - 07:43)
Уважаемый Anthony_Hunter!

Что Вы подразумевали под пробоподготовкой? Только дериватизацию нативных соединений, или же щелочной гидолиз, экстракцию и затем дериватизацию продуктов гидролиза?


Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 25.10.2013 - 10:52
Сообщение #182


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


на 5,7 минуте вещество - Si производное 1-(4-фторбензил)-1H-индол-3-карбоновой кислоты - вероятного метаболита QCBL-BZ-F (8-оксихинолиновой фубинаки).

Получено из нативного вещества
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 28.10.2013 - 14:08
Сообщение #183


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


[quote name='alexlp' date='16.06.2008 - 21:41' post='56355']Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!

Здравствуйте коллеги. Выкладываю производные (Ас, PrO,TFA,PFP) для некоторых стимуляторов, предлагаемых на известных сайтах. С индексами удерживания для НР-5.
Судебная медицина - Прикрепленный файл  A58_25X_NBOMe_AMDISLIB_20131028.zip ( 10.93 килобайт ) Кол-во скачиваний:  371
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 29.10.2013 - 17:08
Сообщение #184


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Цитата(A58 @ 24.10.2013 - 09:57)
Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter.


Здравствуйте коллеги.

Я подразумевал щелочной гидголиз, а за тем дериватизацию в PFP. Если не делать щелочной гидролиз, то вы вряд ли сможете обнаружить малые концентрации и AB-PINACA и AB-FUBINACA. Хотя я могу и ошибаться... я не химик.
Через пару дней выложу библиотеку с PFP производными этих соединений, а еще и с AB-PINACA-F и FUB-PB-22.

Сообщение отредактировал Anthony_Hunter - 29.10.2013 - 17:15
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 29.10.2013 - 17:23
Сообщение #185


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Цитата(A58 @ 24.10.2013 - 09:57)
Здравствуйте! Для соединений типа РВ-22 не надо никакой подготовки. Просто залить их смесью PFP и PFP спирта и сразу пойдет гидролиз РВ. Образуются 2 продукта: эфир PFP кислоты и 8-оксихинолина, а также эфир кислотного остатка РВ и PFP спирта. Именно спектры последних продуктов и выложил Anthony_Hunter.


Еще раз здравствуйте!
Извиняюсь, сколько стоит "залить" смесью пентафторпроионового ангидрида с пентафторпропанолом пробу, чтобы не делать щелочной гидролиз?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 29.10.2013 - 17:49
Сообщение #186


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Anthony_Hunter @ 29.10.2013 - 19:23)
Еще раз здравствуйте!
Извиняюсь, сколько стоит "залить" смесью пентафторпроионового ангидрида с пентафторпропанолом пробу, чтобы не делать щелочной гидролиз?

Расслабтесь. smile.gif
Речь шла о нативных каннабимиметиках...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 30.10.2013 - 06:43
Сообщение #187


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!
Предлагаю обсудить используемые условия хроматографирования и регистрации спектров.
С целью оптимизации и унификации.

Например (форма представления обсуждаема):

Колонка HP5MS 30m x 0.25mm x 250um (с предколонкой)

гн - гелий, постоянный поток. скорость примерно 36 см/сек (около 8 psi при начальной температуре).
Поток устанавливается по ДИФЕНИЛАМИНУ с помощью RTL. RTdpa = 8.689 min.

Программа: 65(1мин) -> 20 гр/мин -> 320(6.25мин) = 20 мин.

Ввод: Pulsed Splitless

Лайнер Single tapered, пустой, силанизированный (лайнеры моются и силанизируются).

Температура инжектора 250
Pulsed Pressure 36.259 psi until 0.5 min
Purge flow to Split Vent 50 ml/min at 1 min
Septum purge(switched) 3 ml/min
Gas saver 15 ml/min after 4 min

Инжекция - автосамплер, стандартный ввод.

Растворитель - этилацетат, изооктан.
Промывки шприца до инжекции - 2 раза
после - 5 раз
Задержка на вязкость - 3 сек.

Задержка на выход растворителя - 3.75 мин

Интерфейс - 290

Источник 230
Квадруполь 150

Массы 42-700
Порог 150
Sample 2
EMV Mode - Gain Factor



Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 30.10.2013 - 08:24
Сообщение #188


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


А не проще индексы удерживания взять? Тогда указывается колонка, газ-носитель да индекс удерживания. Величина все-таки относительная, а посему - достаточно воспроизводимая, как мне кажется. А уж от парафиновой свечки крупинку отколоть проблем не будет ни у кого. Главное, не напутать, где н-алканы, а где - изо.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 30.10.2013 - 09:33
Сообщение #189


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Deminolog @ 30.10.2013 - 10:24)
... А уж от парафиновой свечки крупинку отколоть проблем не будет ни у кого. Главное, не напутать, где н-алканы, а где - изо.

Лучше брать аптечную вощенную бумажку, называется - капсулаторка...
Там почти нет изо-форм. Помыть бумажку размером 1 на 1 см в 5 мл гексана и будет Вам счастье... smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 30.10.2013 - 10:32
Сообщение #190


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Добрый день!
Спасибо за совет! Учту... smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 11 12 13 14 > » 



- Обратная связь Сейчас: 26.06.2025 - 08:57