Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V < 1 2 3 4 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4103
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1085
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  898
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  672
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  587
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  644
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  607
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  957
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  968
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
A58
сообщение 1.11.2010 - 16:38
Сообщение #26


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(KNIISE @ 1.11.2010 - 10:11)
Всех приветствую!
Предлагаю масс-спектры дизайнерских амфетаминов прописывать при малой энергии ионизации: 10 эВ.
Полагаю, это позволит различать их по масс-спектрам, как в случае хим.ионизации, которой у многих нет.

Здоравствуйте! Не все так просто. Я пробовал снимать спектры некоторых аминов, у которых молекулярный ион очень мал (менее 1%) при ЕИ 30,20 10 эВ. спектры несколько изменились по интенсивностям ионов, сами интенсивности уменьшаются при уменьшении ЕИ, однако молекулярные ионы так и не достигли заметной величины. Однако я не пробовал на мефедроне и его аналогах, может быть у Вас получится. Удачи.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 1.11.2010 - 16:47
Сообщение #27


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Всё так...
Если у соединения нет молекулярного ион-радикала, то и не получите в спектре ничего.
Если он мал, то больше он не станет, то есть такой подход будет в ущерб чувствительности к данному соединению.
Аналогично эксперементировал на веществе не образующем молекулярного ион-радикала, результат - "болт железный"...
Только один подход оптимален, как я думаю, если соединение дериватизируется, надо получать его производные. Это справедливо для аналитической и судебной токсикологии, а так же для криминалистов...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 3.11.2010 - 10:39
Сообщение #28


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(A58 @ 1.11.2010 - 15:38)
... Я пробовал снимать спектры некоторых аминов, у которых молекулярный ион очень мал (менее 1%) при ЕИ 30,20 10 эВ. спектры несколько изменились по интенсивностям ионов, сами интенсивности уменьшаются при уменьшении ЕИ, однако молекулярные ионы так и не достигли заметной величины...

Цитата(KSS17 @ 1.11.2010 - 15:47)
...
Если у соединения нет молекулярного ион-радикала, то и не получите в спектре ничего.
Если он мал, то больше он не станет, то есть такой подход будет в ущерб чувствительности к данному соединению.
Аналогично эксперементировал на веществе не образующем молекулярного ион-радикала, результат - "болт железный"...

А жаль!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 10.11.2010 - 19:26
Сообщение #29


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Подарок от Dr. Till Beuerle, Technische Universitaet Braunschweig, Institut fuer Pharmazeutische Biologie, GERMANY: масс-спектры аналогов JWH-018 в NIST-формате (желающие получить в НР-формате или в ПДФе - обращайтесь к нему, мыло - в прилагаемом ПДФе).

Подарок от коллег - 41 спектр в НР-формате JWHей и дизайнерских:

Может кто и не знает: Канадские токсикологи выкладывают в НР-формате библиотеку наркоты и психотропов по адресу http://www.ualberta.ca/~gjones/mslib.htm

А по немцы дают посмотреть структурные формулы и масс-спектры (на картинках гнусного качества) дизайнерских по адресу http://www.designer-drugs.de/ , http://www.designer-drugs.eu/

Всем удачи!


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Structural_Analogues_JWH_018.zip ( 54.44 килобайт ) Кол-во скачиваний:  711
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Structural_Analogues_JWH_018.pdf ( 239.95 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1448
Судебная медицина - Прикрепленный файл  Gekc.zip ( 68.09 килобайт ) Кол-во скачиваний:  718
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 13.11.2010 - 11:57
Сообщение #30


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


К сожалению на указанных сайтах без покупки программы можно посмотреть только структурную формулу, а "картинка гнусного качества" всегда одна и та же.

А есть у кого-нибудь полный перевод на русский инструкции к программе AMDIS?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 13.11.2010 - 14:01
Сообщение #31


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(xumuk @ 13.11.2010 - 13:57)


А есть у кого-нибудь полный перевод на русский инструкции к программе AMDIS?


На сайте Хроматэка
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 16.11.2010 - 10:38
Сообщение #32


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


На сайте Хроматека только краткая инструкция, без подробных объяснений. В установочном комплекте программы AMDIS есть еще полная инструкция на английском (228 страниц), где подробно расписывается вся программа и все ее возможности. Вот про эту то инструкцию я и спрашивал.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 17.11.2010 - 19:34
Сообщение #33


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Возможное решение проблем с прочтением АМДИСом файлов разных форматов освещено на сайте химиков-аналитиков:


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  AMDIS______________________.txt ( 5.62 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1562
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Eugen
сообщение 20.11.2010 - 01:07
Сообщение #34


Вновь прибывший

Группа: Пользователи
Регистрация: 20.11.2010
Пользователь №: 24 145


Цитата(KNIISE @ 10.11.2010 - 19:26)

Может кто и не знает: Канадские токсикологи выкладывают в НР-формате библиотеку наркоты и психотропов по адресу...


Спасибо за ссылку.
А существует ли способ эту библиотеку сконвертировать во что-то, что nist mssearch умеет смотреть? Как эту библиотеку можно посмотреть, если не в привязке к кемстейшн?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 22.11.2010 - 10:32
Сообщение #35


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(Eugen @ 20.11.2010 - 00:07)
...
А существует ли способ эту библиотеку сконвертировать во что-то, что nist mssearch умеет смотреть? Как эту библиотеку можно посмотреть, если не в привязке к кемстейшн?

К АМДИСу в комплекте идет конвертер библиотек.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
xumuk
сообщение 10.12.2010 - 07:15
Сообщение #36


Новичок

Группа: Участники
Регистрация: 13.11.2010
Пользователь №: 24 030


У меня есть библиотека в формате .L, но конвертировать ее в формат .MSP или MSSearch с помощью указанного конвертера не возможно, так как в ней слишком много спектров (больше 65 тысяч). С помощью какой программы можно посмотреть эту библиотеку, и вытащить из нее нужные спектры.

P.S. Просматриваю список НС на предмет наличия спектров в базах приборов и не могу найти таковых для многих соединений, например (из самого начала), альфамепродин, альфаметилтиофентанил и др. Есть ли у кого-нибудь библиотека спектров всех НС, ПВ, прекурсоров, СДВ и ЯВ (которые вообще можно проанализировать на ХМС)? Может быть есть смысл составить такую библиотеку?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 10.12.2010 - 11:55
Сообщение #37


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Цитата(xumuk @ 10.12.2010 - 06:15)
У меня есть библиотека в формате .L, но конвертировать ее в формат .MSP или MSSearch с помощью указанного конвертера не возможно, так как в ней слишком много спектров (больше 65 тысяч). С помощью какой программы можно посмотреть эту библиотеку, и вытащить из нее нужные спектры..


Аджилентовская МС-оболочка Хемстейшен.

Цитата(xumuk @ 10.12.2010 - 06:15)
.. Есть ли у кого-нибудь библиотека спектров всех НС, ПВ, прекурсоров, СДВ и ЯВ (которые вообще можно проанализировать на ХМС)? Может быть есть смысл составить такую библиотеку?


_http://www.police-russia.ru/showthread.php?t=20196&page=18
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Anthony_Hunter
сообщение 10.12.2010 - 17:41
Сообщение #38


Читатель

Группа: Участники
Регистрация: 14.04.2010
Пользователь №: 21 103


Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 10.12.2010 - 18:08
Сообщение #39


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(Anthony_Hunter @ 10.12.2010 - 17:41)
Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...

Масс-спектр нафирона где-то приводился на форуме месяца 2 назад. Поищите поиском. Он не образует TFA производных, как и МДПВ. Его спектр остается неизменным при любых дериватизациях.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
A58
сообщение 11.12.2010 - 21:05
Сообщение #40


Продвинутый участник

Группа: СМЭ
Регистрация: 4.02.2010
Из: Урал-Батюшка
Пользователь №: 19 783


Цитата(Anthony_Hunter @ 10.12.2010 - 17:41)
Здравствуйте, коллеги!
А есть ли у кого нибудь библиотека с нафироном и его TFA-производными для AMDIS?
Если есть, поделитесь пожалуйста! А то я боюсь, что его пропускаю...

Прошу прощения. Сразу сам не нашел спектр на форуме. Вот сслылка:
http://www.sudmed.ru/index.php?showtopic=1...mp;hl=naphyrone
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V < 1 2 3 4 > » 



- Обратная связь Сейчас: 28.06.2025 - 10:33