[alexlp]

Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Хочу предложить вам библиотечку, созданную из Каймана и SWG путем отбора из них спектров метаболитов  saymanswg_methabolites_20140221.pdf ( 16.22 килобайт ) Кол-во скачиваний:  481

Для чего? Для поиска, например, гидроксилированных по алифатической цепи метаболитов каннабимиметиков при дериватизации тем, что эти гидроксилы не дериватизирует.

Предлагаю добавить эту библиотечку к сводной библиотеке SUDMED.

Пожалуйста, выскажите свое мнение!

[KSS17]

Здравствуйте!
Обсуждение идентификации метаболитов AM-2201 и THJ-2201 выделил в отдельную тему.
Ссылка

[alexlp]

Уважаемые Коллеги?

Иногда они возвращаются...

Наконец то (для нас) получили спектр гидроксилированного метаболита APINACA!
На картинке - хроматограмма ТФЭкстракта из кислотно-щелочного гидролизата, первая фракция(из кислой среды, с С18). Библиотечный спектр - сконструирован.
Интересна ли тема? Выкладывать ли еще материалы?

[Korvet]

конечно интересно!
надо же, как раз думал заняться этим веществом!

[alexlp]

конечно интересно!
надо же, как раз думал заняться этим веществом!

В аттаче - та хроматограмма и библиотечка со сконструированными упрощенными спектрами. (ПРИМЕНЯТЬ С ОСТОРОЖНОСТЬЮ! В библиотечке - только предположения! Возможны ошибки!)

[hot_assay]

Здравствуйте!

Обновление будет выложено после внесения исправлений...

внесение исправлений ещё не завершено?

[Korvet]

спасибо! сделаем пакетный поиск по периоду когда оно широко шло (декабрь 2012-февраль 2013)...может и цапанем чего.

[alexlp]

внесение исправлений ещё не завершено?

KSS17, Korvet ??

[Korvet]

ну я вроде послал свои соображения.

1. предлагаю 5F-AMB называть так как он уже вошел в базы данных криминалистов
индольный собрат будет называтся MMB-2201, индазольный будет MMB(N)-2201.

Мethyl 2-[1-(5-fluoropentyl)-1H-indol-3-ylcarboxamido]-3-methylbutanoate

2. соответсвенно метаболиты (продукты гидролиза) например MMB-2201 - carboxy

[alexlp]

ну я вроде послал свои соображения.

1. предлагаю 5F-AMB называть так как он уже вошел в базы данных криминалистов
индольный собрат будет называтся MMB-2201, индазольный будет MMB(N)-2201.

Мethyl 2-[1-(5-fluoropentyl)-1H-indol-3-ylcarboxamido]-3-methylbutanoate

2. соответсвенно метаболиты (продукты гидролиза) например MMB-2201 - carboxy

Я - за унификацию. KSS17?

[alexlp]

внесение исправлений ещё не завершено?

Уважаемые Коллеги!

Наша сводная библиотека расширилась на 129 спектров:

818 SDB-006
819 (E)-4-Chloro-N-(1-(4-nitrophenylethyl)piperidin-2-ylidene)sulfonamide
820 W-15
821 Naphthalene, 1-methoxy-
822 Silane, trimethyl(1-naphthalenyloxy)-
823 XLR11 M28 (-COOH) degradan2cyclo Me
824 XLR11 M27 (-COOH) degradant Me
825 XLR11 M28 (-COOH) degradant Me
826 XLR11 M28 (-COOH) degradant TMS
827 5-fluoro-AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
828 AB-PINACA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
829 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
830 AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
831 AM2201 5-hydroxyindole metabolite
832 AM2201 6-hydroxyindole metabolite
833 AM2201 7-hydroxyindole metabolite
834 AM2201 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
835 Buphedrone metabolite
836 JWH 018 N-(4-oxo-pentyl) metabolite
837 JWH-018 N-(2-hydroxypentyl) metabolite
838 JWH-018 N-(3-hydroxypentyl) metabolite
839 JWH-018 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
840 JWH-018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite 841 JWH-019 5-hydroxyindole metabolite
842 JWH-019 N-(5-hydroxyhexyl) metabolite
843 JWH-019 N-(6-hydroxyhexyl) metabolite
844 JWH-073 2-hydroxyindole metabolite
845 JWH-073 N-(2-hydroxybutyl) metabolite
846 JWH-073 N-(3-hydroxybutyl) metabolite
847 JWH-073 N-(4-hydroxybutyl) metabolite
848 JWH-081 4-hydroxynaphthyl metabolite
849 JWH-081 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
850 JWH-081 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
851 JWH-122 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
852 JWH-122 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
853 JWH-200 4-hydroxyindole metabolite
854 JWH-200 5-hydroxyindole metabolite
855 JWH-200 6-hydroxyindole metabolite
856 JWH-200 7-hydroxyindole metabolite
857 JWH-203 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
858 JWH-203 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
859 JWH-210 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
860 JWH-210 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
861 JWH-250 5-hydroxyindole metabolite
862 JWH-250 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
863 JWH-250 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
864 JWH-398 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
865 MDPV metabolite
866 Normephedrone
867 RCS-4 4-hydroxyphenyl metabolite
868 RCS-4 M10 Metabolite
869 RCS-4 M11 metabolite
870 RCS-4 M9 metabolite
871 RCS-4 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
872 RCS-4 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
873 UR-144 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
874 XLR11 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
875 α-Pyrrolidinopentiophenone metabolite
876 (±)-JWH 018 N-(2-hydroxypenyl) metabolite
877 (±)-JWH 018 N-(3-hydroxypentyl) metabolite
878 (±)-JWH 018 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
879 (±)-UR-144 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
880 5-fluoro-AKB48 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
881 a-Pyrrolidinopentiophenone metabolite 1
882 AB-PINACA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
883 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
884 AKB48 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
885 JWH 018 N-(4-oxo-pentyl) metabolite
886 JWH 018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
887 JWH 019 5-hydroxyindole metabolite
888 JWH 019 N-(5-hydroxyhexyl) metabolite
889 JWH 019 N-(6-hydroxyhexyl) metabolite
890 JWH 073 2-hydroxyindole metabolite
891 JWH 073 N-(2-hydroxybutyl) metabolite
892 JWH 073 N-(3-hydroxybutyl) metabolite
893 JWH 073 N-(4-hydroxybutyl) metabolite
894 JWH 081 4-hydroxynaphthyl metabolite
895 JWH 081 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
896 JWH 081 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
897 JWH 122 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
898 JWH 122 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
899 JWH 200 4-hydroxyindole metabolite
900 JWH 200 5-hydroxyindole metabolite
901 JWH 200 6-hydroxyindole metabolite
902 JWH 200 7-hydroxyindole metabolite
903 JWH 203 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
904 JWH 203 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
905 JWH 210 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
906 JWH 210 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
907 JWH 250 5-hydroxyindole metabolite
908 JWH 250 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
909 JWH 250 N-(5-hydroxypentyl) metabolite
910 JWH 398 N-(4-hydroxypentyl) metabolite 911 JWH-018 N-(5-hydroxypentyl) metabolite-d5
912 MDPV metabolite 2
913 JWH-022(indazol)$$$3-(1-Naphthoyl)-1-(pent-4-enyl)indazol$$$(InChI=1/C24H21NO/c1-2-3-8-16-25-17-22(20-13-6-7-15-23(20)25)24(26)21-14-9-11-18-10-4-5-12-19(18)21/h2,4-7,9-15,17H,1,3,8,16H2)
914 JWH-018(indazol) N-(5-hydroxypentyl) metabolite$$$InChI=1/C23H22N2O2/c26-16-7-1-6-15-25-21-14-5-4-12-20(21)22(24-25)23(27)19-13-8-10-17-9-2-3-11-18(17)19/h2-5,8-14,26H,1,6-7,15-16H2
915 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-3$$
916 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-2$$
917 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso1$$
918 AM(indazol)-2201-C5-chain-OH-TMS-iso-4$$
919 JWH-018(Indazol)-5OH-TMS
920 JWH-018(Indazole)-5-OH-TMS$$InChI=1/C26H30N2O2Si/c1-31(2,3)30-19-10-4-9-18-28-24-17-8-7-15-23(24)25(27-28)26(29)22-16-11-13-20-12-5-6-14-21(20)22/h5-8,11-17H,4,9-10,18-19H2,1-3H3
921 JWH-018(Indazole)-5-COOH-TMS$$InChI=1/C26H28N2O3Si/c1-32(2,3)31-24(29)17-8-9-18-28-23-16-7-6-14-22(23)25(27-28)26(30)21-15-10-12-19-11-4-5-13-20(19)21/h4-7,10-16H,8-9,17-18H2,1-3H3
922 THJ2201-M5 (-COOH) Me
923 THJ2201-M5 (-COOH) TMS
924 THJ2201-M1 (5-OH) TMS
925 THJ2201-M (-C2-COOH) TMS
926 THJ2201-M (C2-COOH) Me
927 Quinoline, 8-methoxy-
928 AKB48-M1-TMS
929 THJ-2201 M2 (-F, COOH), TMS
930 THJ-2201 M1 (-C2H4F, COOH), TMS-
931 AM-2201 (-C2H4F, 3-COOH), methyl-
932 THJ-2201-M2 (-F, Alk-COOH), methyl-
933 THJ-2201-M1 (-C2H4F, COOH), methyl-
934 THJ-2201-M4 (-F, Alk-4-en, indazol-OH), methyl-
935 5F-AB-PINACA -M marker, methyl-
936 XLR11 M28 # UR-144 # TMCP-018, N-pentanoic acid metabolite, methyl- (thermal isomer)
937 XLR11 (-F, COOH) degradant, methyl-
938 XLR11 (-C2H4F, 3-COOH) # UR-144 M (-C2H4, 3-COOH) thermoisomer, methyl-
939 XLR11 M28 # UR-144 # TMCP-018, N-pentanoic acid metabolite, methyl-
940 MMB-2201
941 MMB-2201 M (-COOH) TMS
942 MMB-2201 marker, TMS-
943 MMB-2201 marker, ethyl-
944 MMB-2201 marker, di-TMS-
945 MMB-2201 / MMB-2201 marker, metyl-
946 MMB-2201

Из них 86 спектров - это спектры нативных метаболитов каннабимиметиков из библиотек Cayman и SWG (содержащие ссылки на источник спектра)  saymanswg_metabolites.pdf ( 13.79 килобайт ) Кол-во скачиваний:  895

Картинки имеющихся структур всех добавленных соединений - тут:  SUDMED_946_NISTLIB_20140308_new_structures.pdf ( 52 килобайт ) Кол-во скачиваний:  656

Список всех вновь добавленных спектров- тут:  SUDMED_946_NISTLIB_20140308_new.pdf ( 18.58 килобайт ) Кол-во скачиваний:  690


Дополнительно включены спектры метильных и ТМС эфиров нафтола, который может быть обнаружен в экстрактах после гидролиза таких соединений, как FDU-PB22 и его производных, а так же спектр Quinoline, 8-methoxy-.

Если вы выявили неточности, ошибки в спектрах - пожалуйста сообщите об этом или в этой ветке, или в ЛС.

[hot_assay]

Огромное спасибо!

[hot_assay]

странноватый спектр

[KSS17]

Здравствуйте!
Да, потерян 109 ион, он 100% в спектре (ион 282 имеет 45%). Видимо пик вещества был перегружен.

[hot_assay]

Здравствуйте!
Да, потерян 109 ион, он 100% в спектре (ион 282 имеет 45%). Видимо пик вещества был перегружен.

именно это я и имел в виду