Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 21 22 23 24 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4102
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1084
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  897
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  671
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  586
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  642
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  606
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  953
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  964
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 13.07.2014 - 23:37
Сообщение #326


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Сводная библиотека дополнена 30 спектрами различных дериватов метаболитов АЦЕТИЛФЕНТАНИЛА, любезно предоставленными уважаемым A58 в распоряжение сообщества:
Цитата
У одинаковых производных спектры многих метаболитов почти одинаковые, поэтому ориентироваться можно только на RI. Мол. массы подтверждены методом ВЭЖХ-МС. Прилагаю также схему метаболизма, чтобы разобраться, где чей метаболит.
Судебная медицина - Прикрепленное изображение
...
Acetylfentanyl M(nor-) ethylformat artifact-Эти артифакты образуются, когда для экстракции используют старый хлороформ (фосген), иногда такая дериватизация проходит почти полностью. https://www.dropbox.com/s/hxgbgeblndnh6lv/A...___artifact.gif

1 Acetylfentanyl M(HO-) isomer2 PrO
2 Acetylfentanyl M(HO-) isomer2 Ac
3 Acetylfentanyl M(desacetyl-, nor-) 2TFA
4 Acetylfentanyl M(desacetyl-, nor-) 2PrO
5 Acetylfentanyl M(desacetyl-, nor-) 2PFP
6 Acetylfentanyl M(desacetyl-) PFP
7 Acetylfentanyl M(desacetyl-) TFA
8 Acetylfentanyl M(nor-) PFP
9 Acetylfentanyl M(nor-) PrO
10 Acetylfentanyl M(nor-) Ac
11 Acetylfentanyl M(nor-) TFA
12 Acetylfentanyl M(nor-)
13 Acetylfentanyl M(HO-, MeO-) PrO
14 Acetylfentanyl M(HO-, MeO-) PFP
15 Acetylfentanyl M(HO-, MeO-) TMS
16 Acetylfentanyl M(HO-) TMS
17 Acetylfentanyl M(HO-, MeO-) Ac
18 Acetylfentanyl M(desacetyl-, HO-) 2PrO
19 Acetylfentanyl M(HO-) isomer1 PrO
20 Acetylfentanyl M(desacetyl-, HO-,MeO-) 2PrO
21 Acetylfentanyl M(HO-) isomer1 PFP
22 Acetylfentanyl M(HO-) isomer1 Ac
23 Acetylfentanyl M(2HO-) 2PFP
24 Acetylfentanyl M(desacetyl-, HO-) 2PFP
25 Acetylfentanyl M(desacetyl-, HO-,MeO-) 2PFP
26 Acetylfentanyl M(desacetyl-, 2HO-) 3PFP
27 Acetylfentanyl M(2HO-) 2Ac
28 Acetylfentanyl M(nor-) ethylformat artifact
29 Acetylfentanyl M(desacetyl-)
30 Acetylfentanyl
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 19.07.2014 - 14:35
Сообщение #327


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата
Dear Colleagues,
the literature uses extensively codes and acronyms to name designer drugs and cannabimimetics very often applying different codes and acronyms to name the very same compound. This fact complicates the searching of these compounds in the literature and the internet. Therefore a list with records of all occurred synonyms was generated. An entry in the list of synonyms usually begins with a code or acronym followed by a sequence of denominations for the same compound.
If no code or acronym exist the international non-proprietary name or in minor priority the exact chemical name is used.
The "Synonyms Thesaurus of Cannabimimetics" naming 2914 compounds is an extract of the "Molecular and Pharmacological Review of Cannabimimetics" which will be offered soon as a database accessible by the "Designer Drugs Online" internet address:https://db12.designer-drugs.de/login.pl.

________________________________________________________________
DigiLab Software GmbH, Posener Str. 18, 24161 Altenholz, Germany
Managing Director: Dr. Peter Roesner
VAT: DE 134878935, Amtsgericht Kiel HRB 508 EC

Уважаемые коллеги,
литература широко использует коды и сокращения назвать дизайнерских наркотиков и каннабимиметиков очень часто применяющих различные коды и сокращения назвать очень же соединение. Этот факт усложняет поиск этих соединений в литературе и в Интернете. Поэтому список с записями всех произошедших синонимы был сгенерирован. Запись в списке синонимов обычно начинается с кода или аббревиатурой и последовательности номиналов для того же соединения. Если код или акроним не существует международное непатентованное название или меньшим приоритетом используется точное химическое название. "Синонимы Тезаурус каннабимиметиков" именования 2914 соединений является выписка из «Молекулярная и фармакологического Обзор каннабимиметики", который будет предлагаться только в качестве базы данных доступны на "дизайнерских наркотиков Online" адрес в Интернете: https://db12.designer-drugs.de/login.pl.

SynonymsThesaurus_486.pdf

Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 19.07.2014 - 16:12
Сообщение #328


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(alexlp @ 19.07.2014 - 17:35)
Уважаемые коллеги,
литература широко использует коды и сокращения назвать дизайнерских наркотиков и каннабимиметиков очень часто применяющих различные коды и сокращения назвать очень же соединение. ... "Синонимы Тезаурус каннабимиметиков" именования 2914 соединений ...


Вот товарищи из Германии не стесняются называть каннабимиметики - каннабимиметиками.
Кто любит "юридическую" чистоту, могут взять эту ссылку на заметку. smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 19.07.2014 - 16:27
Сообщение #329


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


это не юридическая чистота. а как бы "научная чистота". Юридическая чистота соответствует использованию терминологии, которой даны определения в законах, указах, кодексах и пр. Пример - "наркотические средства", а не вещества к примеру. и пр.

я же уже думал тоже об этом. Конечно понятию "СК" или просто каннабимиметики едва ли будет дано когда либо юридическая трактовка. Но вот назвать вещество каннабимиметиком наверное можно, если где либо описаны его свойства как каннабимиметика. Например приведены константы аффиности и пр. я раньше видел много подобных статей где описаны сразу чуть не сотни веществ, и приведены их афинности. по моему журнал "медицинской химии"...(по английски конечно)...там почти нету спектральных характеристик этих веществ, но даны пути синтеза и описаны свойства...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 19.07.2014 - 16:36
Сообщение #330


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Цитата(Korvet @ 19.07.2014 - 16:27)
это не юридическая чистота. а как бы "научная чистота". Юридическая чистота соответствует использованию терминологии, которой даны определения в законах, указах, кодексах и пр. Пример - "наркотические средства"...
А если, как в Казахстане, в Законе, которым определяется перечень подконтрольных веществ, будет выделена группа "Синтетические каннабиноиды"? Этого для "юридической чистоты" будет достаточно? wink.gif
Вот ссылка: Закон Республики Казахстан от 10 июля 1998 года № 279-I «О наркотических средствах, психотропных веществах, прекурсорах и мерах противодействия их незаконному обороту и злоупотреблению ими» (с изменениями и дополнениями по состоянию на 13.01.2014 г.) - см. Приложение 1, Таблица 1, В. ПСИХОТРОПНЫЕ ВЕЩЕСТВА, п. 38
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 19.07.2014 - 17:06
Сообщение #331


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Korvet @ 19.07.2014 - 19:27)
это не юридическая чистота. а как бы "научная чистота". ...

Потому "юридическая" как бы в скобках, типа не от себя, то есть с себя ответственность ссылкой сымаем... biggrin.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 19.07.2014 - 17:31
Сообщение #332


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Саш, а чего нам до казахстана, я не понял? ты имеешь в виду этот таможенный союз что-ли..., Ваши запреты наркоты у нас же не действуют, а почему кахахская терминология должна работать...по моему это все на бумаге только, да вот кружевные трусы еще запретили к ввозу...и весь союз...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
RedPepper
сообщение 19.07.2014 - 18:28
Сообщение #333


Маэстро форума

Группа: Участники
Регистрация: 29.11.2010
Пользователь №: 24 313


Цитата(Korvet @ 19.07.2014 - 17:31)
Саш, а чего нам до казахстана, я не понял? ты имеешь в виду этот таможенный союз что-ли..., Ваши запреты наркоты у нас же не действуют, а почему кахахская терминология должна работать...по моему это все на бумаге только, да вот кружевные трусы еще запретили к ввозу...и весь союз...
Сорри, моя реплика относилась вот к этой части твоего сообщения:
Цитата(Korvet @ 19.07.2014 - 16:27)
понятию "СК" или просто каннабимиметики едва ли будет дано когда либо юридическая трактовка
...вот я и привёл в качестве примера казахские списки - т.е. наши казахские коллеги и не парились над юридической трактовкой - просто прописали в списках группу - вот я о чём...

Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 19.07.2014 - 19:15
Сообщение #334


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


ха, вот как раз они и "парились", точнее говоря теперь есть закон в котором прописано что такое СК, а именно исчерпывающий, и конечный список веществ, и соответственно уже просто так не скажешь (с юридической точки зрения) что вещество А является СК, если оно не входит в тот список...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 5.09.2014 - 19:51
Сообщение #335


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Сводная библиотека дополнена 22 спектрами из rf-des_drug_01.09.2014

1 MDBM-CHM artefact
2 MDBM-CHM artefact
3 MDMB-CHMINACA
4 MDMB(N)-CHM
5 4-Methylbuphedrone
6 SDB-006
7 SDB-006
8 MMB(N)-2201
9 methyl 1-(5-fluoropentyl)-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-3-carboxylate
10 Dimethocaine
11 α-PHP
12 DMBA(O)-CHM
13 EMB(N)-CHM
14 PMB(N)-CHM
15 MBAcid(N)-CHM
16 MBAcid(N)-CHM
17 MMB(N)-CHM
18 Amfonelic acid
19 4-CMC
20 4-CMC, -TFA
21 4-CMC, -TFA
22 MDMB(N)-FUB


Кроме того, дополнительно сконвертировал библиотеку в формат хемстанции AgilentChemStation -SUDMED_1442_ACSLIB_20140707.L
Возможно, кому либо будет полезно и удобно..
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Chimik
сообщение 8.09.2014 - 14:01
Сообщение #336


Претендент

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 6.10.2011
Пользователь №: 29 196


Здраствуйте)) Не могу разобраться какие массы характерны для пролинтана и его метаболитов, альфа-пвп и его метаболитов и с МДПВ не все ясно.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 9.09.2014 - 08:48
Сообщение #337


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Chimik @ 8.09.2014 - 17:01)
Здраствуйте)) Не могу разобраться какие массы характерны для пролинтана и его метаболитов, альфа-пвп и его метаболитов и с МДПВ не все ясно.


Для всего названного характерны m/z 126, 140.
Для нативного соединения и ряда метаболитов 126. Для метаболитов (лактамной группы, их зовут "оксо") 140 и 98.
Очень грустные спектры для групп соединений с m/z 126. Подходящими маркерами можно считать метаболиты с m/z 140.
Конкретные соединения можно идентифицировать по индексам удерживания.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Chimik
сообщение 9.09.2014 - 13:53
Сообщение #338


Претендент

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 6.10.2011
Пользователь №: 29 196


Спасибо, KSS17! И как понимаю, в основном встречаются α-PVP и его охо-метаболит и МДПВ, а офф. библиотека (например, НИСТ11) говорит, что это пролинтан, хотя не факт...

Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 9.09.2014 - 16:25
Сообщение #339


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Нет в NIST11 спектров PVP, MDPV и их метаболитов.
У нас сейчас порядка 70-80% идет PVP, причем в моче эта гнустность редко определяется в нативном виде. Основные метаболиты гидрокси- и лактам идут хорошо.
МДПВ в моче определяется сам и лактам, соответственно.

Лактамы (оксо-метаболиты) - образуются в следствие гидролиза (кислотного) или при ацелировании (дегидротация) в процессе внутримолекулярной циклизации основных метаболитов PVP и MDPV. Сами лактамные формы метаболитов выводятся в нативном виде с мочой в незначительных количествах.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Chimik
сообщение 11.09.2014 - 13:46
Сообщение #340


Претендент

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 6.10.2011
Пользователь №: 29 196


Благодарствую, KSS17!!!
Разобрался) Да, у нас тоже в последнее время в основном PVP.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 21 22 23 24 > » 



- Обратная связь Сейчас: 23.06.2025 - 23:12