[alexlp]

Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35

[Korvet]

относительно метаболита вещество APINACA которое в библиотеке здесь занесено как AKB48-M1-TMS, могу заявить что подтвердил его наличие вэжх-мсвр.

То есть в образце где я нахожу методом ВЭЖХ-мсвр данный метаболит, при силировании, наблюдаю и спектр приведенный в библиотеке...
только мой RI 3419

Сообщение отредактировал Korvet - 17.10.2014 - 11:57

[Tatarin_116]

относительно метаболита вещество APINACA которое в библиотеке здесь занесено как AKB48-M1-TMS, могу заявить что подтвердил его наличие вэжх-мсвр.

То есть в образце где я нахожу методом ВЭЖХ-мсвр данный метаболит, при силировании, наблюдаю и спектр приведенный в библиотеке...
только мой RI 3419

Ну вот, один из знатоков подтвердил! А остальные? Только пользоваться? Ну еще можно (и модно!!!) подтвердить дюжиной докладов по одному и тому же веществу, а главное - в первый день конференции? Так, сказать - ответ на "вызов" времени?

Сообщение отредактировал Tatarin_116 - 17.10.2014 - 15:32

[alexlp]

Ну вот, один из знатоков подтвердил! А остальные только пользоваться? Или дюжиной докладов по олдному веществу в один день конференции?

Есть конструктивные предложения? Научите - как надо?

Сообщение отредактировал alexlp - 17.10.2014 - 15:32

[Tatarin_116]

Есть конструктивные предложения? Научите - как надо?

Боржоми, как говорится, коллега, пить уже поздно... где ж вы были уважаемый лет пять назад?

[Korvet]

Боржоми, как говорится, коллега, пить уже поздно... где ж вы были уважаемый лет пять назад?

Господа, ну опять начинаете...пять лет назад Alexlp был здесь же и даже шесть лет тоже, гляньте на дату начала этой ветки 16.06.2008 - 22:41
можно долго и увлеченно спорить о том ах как плохо иметь БД в которой есть неподтвержденные стр-ры, но никто я думаю в здравом уме не станет спорить с тем что накопленный материал по метаболитам и дизайнам надо хотя бы систематизировать...чем автор этой ветки и занимается, и одно только это, есть очень хорошее дело....не говоря о остальном.

Предлагаю лучше обсудить такой скользкий момент так сказать "перекрестной идентификации". Я думаю конечно об поговорить в мск, но сначала хочу здесь. Вот допустим я вижу в образце на ВЭЖХ метаболит, подтверждаю его насколько могу. Могу ли я дальше переносить эти данные на гх-мс? без выделения вещества? То есть насколько корректно то что я написал про апинаку, вот что я бы хотел обсудить...

[A58]

Боржоми, как говорится, коллега, пить уже поздно... где ж вы были уважаемый лет пять назад?

Да нет боржоми пить еще не поздно, Вы проявите активность в разделе "помогите с экспертизой" и "народ к Вам потянется".

[Tatarin_116]

Да нет боржоми пить еще не поздно, Вы проявите активность в разделе "помогите с экспертизой" и "народ к Вам потянется".

Спешу непременно, в т.ч. и с помощью по "систематизации" о которой пишет Корвет)))Улыбнуло в очередной раз)))

[A58]

Спешу непременно, в т.ч. и с помощью по "систематизации" о которой пишет Корвет)))Улыбнуло в очередной раз)))

Ну тогда , Вам лучше "тусоваться" в другом форуме.

[Tatarin_116]

Ну тогда , Вам лучше "тусоваться" в другом форуме.

Спасибо, непременно воспользуюсь Вашим, уважаемый А58, советом. К сожалению, наверное именно так

[alexlp]

Спешу непременно, в т.ч. и с помощью по "систематизации" о которой пишет Корвет)))Улыбнуло в очередной раз)))

Улыбчивый
Улыбнуло...

[Deminolog]

Коллеги, не нужно ссор и споров, все в одной лодке плывем (даже те, кто эту тему задевает лишь по касательной). Сколько людей - столько и мнений, а рассудит всех нас время, поэтому если уж и спорить - то только конструктивно.

Относительно переноса с ВЭЖХ-МС/МС на ГХ-МС - порой так и делают, это можно заметить в разных статьях (если необходимо - найду и сброшу). Правда, в этом случае надо бы очень внимательно отнестись к фрагментации.
Откровенно говоря, фракционирование метаболитов - это очень трудоемкий и, иногда, практически нереальный процесс... Но так как все понимают, что работать-то надо, то наличие МСВР, сопоставление данных и их корректная трактовка с ГХ-МС могут приниматься с оговоркой в конце: "несмотря на это для подтверждения полученных данных рекомендуется провести встречный синтез предложенных метаболитов или выделить необходимое количество из билолгических жидкостей". Статьи с подобными формулировками, думаю, видел каждый из Вас :-)

[Tatarin_116]

Уважаемые аксакалы форума и раздела "Аналитическая и судебная токсикология"!, а такжеА58 и alexlp. Если в чем-то из своих суждений не был толерантен, то приношу свои извинения... Надеюсь на дальнейшее продуктивное общение

Сообщение отредактировал Tatarin_116 - 21.10.2014 - 18:07

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередное пополнение библиотеки:

6 спектров метаболитов из Каймана:
1 AB-CHMINACA metabolite M1A
2 ADB-PINACA N-(4-hydroxypentyl) metabolite
3 ADB-PINACA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
4 ADBICA N-(4-hydroxypentyl) metabolite
5 ADBICA N-(5-hydroxypentyl) metabolite
6 XLR11 6-hydroxyindole metabolite

3 спектра метаболитов-маркеров MDMB(N)-Bz-F (конфирмация ЖХМСВР):
7 MDMB(N)-Bz-F Marker TMS $#$ ADB-FUBINACA Marker TMS
8 MDMB(N)-FUB-M (COOH) TMS $#$ ADB-FUBINACA Marker TMS
9 MDMB(N)-Bz-F Marker PFP $#$ ADB-FUBINACA Marker PFP

Еще один спектр из Каймана:
10 ADB-FUBINACA

5 спектров из rf-des_drug_08.10.2014 :
11 α-PBP
12 1-phenyl-2-(pyrrolidin-1-yl)but-2-en-1-one
13 DMBA(N)-CHM
14 MDMB(N)-CHM
15 MMB(N)-Bz-F

Буду признателен за выявленные ошибки и не точности!

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Наш уважаемый Коллега, Савчук Сергей Александрович, любезно предоставил в общее пользование библиотеки, ассоциированные с информационными письмами ННЦ Наркология, и уже известные, и применяемые в некоторых лабораториях.
Это библиотеки
sav50.msp и
SAV_TMSr4.msp.
Теперь они получают унифицированные наименования
pub_sav50_sudmed_464_amdislib_20141027 и
PUB_SAV_TMSR4_SUDMED_156_AMDISLIB_20141027.
Библиотеки доступны для свободного скачивания.
В скором времени часть спектров из этих библиотек будет включена в сводную библиотеку SUDMED.
Критерий отбора - синтетические дизайнерские наркотики и каннабимиметики.
Кроме того, вскоре в сводную библиотеку будут включены оригинальные спектры СК из библиотеки
PB_FUB_Chm_all_v8.msp
того же автора.

ЗЫ:Полагаю, что есть смысл эти библиотеки так же закрепить в топе.

[KSS17]

Здравствуйте!
Размещена библиотека мс-мс-спектров высокого разрешения SUDMED_lc-ms-ms от Korveta.

Состав пакета: файл SUDMED_lc-ms-ms.cdb - база данных масс-спектров соударений высокого разрешения в формате ПО MassHunter, включающая информацию о веществах и их структурах.

Библиотека включает спектры метаболитов, нативных веществ "дизайнерских наркотиков" наиболее часто встречающихся в практике химико-токсикологической лаборатории

В библиотеку вошли спектры опубликованные, в научных публикациях, а также спектры проверенные с помощью базы данных Broecker, Herre, and Pragst master forensic and toxicology accurate mass compound database with accurate mass MS/MS spectra.