Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 28 29 30 31 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4102
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1082
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  897
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  671
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  586
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  642
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  606
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  951
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  962
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 25.01.2015 - 21:43
Сообщение #431


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Обнаружилась очень интересная особенность форматов MSP и MSL:

При конвертации библиотеки из НИСТ в MSP сохраняется информация о синонимах. Если в АМДИС вести поиск по библиотеке MSP, то эта информация остается доступной через кнопку Info и затем кнопку View и затем выбора режима отображения - Text. (см. прилагаемую картинку).Судебная медицина - Прикрепленное изображение
Это во многих случаях может быть удобно и полезно.
К сожалению, при конвертации MSP в MSL информация о синонимах теряется...

В случае же, если библиотека изначально создавалась в АМДИСе, и информация о компаунде (синонимы, хим.названия) была внесена через кнопку Compaund, эта информация уходит во второй файл с расширением CID и становится недоступной при конвертации в НИСТ.

Вот такие причуды конвертаций! blink.gif (респект KSS17!)
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 28.01.2015 - 19:16
Сообщение #432


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

В библиотеку добавлены новые спектры из статьи http://www.sudmed.ru/index.php?act=Attach&...st&id=17996, а так же то, что в статью не вошло: метаболиты 5-фтор AB-PINACA, в основном, в виде метиловых и ТМС эфиров (Респект уважаемому KSS17!).

1 5-Fluoro AB-PINACA M1 (marker), methyl-
2 5-Fluoro AB-PINACA M1, bisTMS-
3 5-Fluoro AB-PINACA M1, PFPA/PFPOH # 5F-AMB M1, PFPA/PFPOH
4 5-Fluoro AB-PINACA M1, TMS
5 5-Fluoro AB-PINACA M2 (3-COOH), methyl-
6 5-Fluoro AB-PINACA M2 (3-COOH), TMS-
7 5-Fluoro AB-PINACA M3 (Alk-COOH), dimethyl-
8 5-Fluoro AB-PINACA M3 (Alk-COOH), diTMS
9 5-Fluoro AB-PINACA M4 (-F, Alk-COOH), Me
10 5-Fluoro AB-PINACA M4 (-F, Alk-COOH), Me, bisTMS
11 5-Fluoro AB-PINACA M4 (-F, Alk-COOH), Me, N-TMS
12 5-Fluoro AB-PINACA M5 (-F, Alk-5-OH), methyl-
13 5-Fluoro AB-PINACA M5, (-F, Alk-OH), bis-TMS
14 5-Fluoro AB-PINACA M5, (-F, Alk-OH), PFPA/PFPOH
15 5-Fluoro AB-PINACA M6 (Alk -OH), methyl-
16 5-Fluoro AB-PINACA M6 (Alk-OH), Me, TMS, isomer 1
17 5-Fluoro AB-PINACA M6 (Alk-OH), Me, TMS, isomer 2
18 5-Fluoro AB-PINACA M6.2, diTMS
19 5-Fluoro AB-PINACA M6.2, methyl-, acetyl-
20 5-Fluoro AB-PINACA M7.1 (Ar-OH), dimethyl-


Все спектры дополнены структурами (в НИСТе) и синонимами в нотации международно-тривиальной и белорусско-российской тривиально-систематической номенклатуры.

Что бы воспользоваться синонимами в АМДИСе рекомендую использовать MSP версию библиотеки.

Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!

Сообщение отредактировал alexlp - 28.01.2015 - 19:20
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 29.01.2015 - 10:03
Сообщение #433


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Хотелось бы составить представление о том, кто пользуется библиотекой SUDMED и в каком объеме? Если вас не затруднит, не могли бы вы дать такую информацию через личные сообщения мне?

Заранее благодарен!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
pek
сообщение 2.02.2015 - 16:59
Сообщение #434


Вновь прибывший

Группа: Участники
Регистрация: 2.02.2015
Пользователь №: 41 290


Подскажите коллеги: у меня поставлена задача, предоставить хроматограмму с изменениями по времени одного и того же вещества (например героин). т.е. сделать каждый месяц или год по одному и уже объединить потом полученные графики на одном (для наглядности) может есть у кого готовое и чтото подобное? biggrin.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
chemist-sib
сообщение 2.02.2015 - 18:37
Сообщение #435


Магистр форума

Группа: Токсикологи
Регистрация: 24.02.2010
Из: Сибирь большая...
Пользователь №: 20 201


чтобы ускорить процесс "старения" - поднимите температуру, влажность и освещенность - типа, климатической камеры. иначе можете "до пенсии не успеть" wink.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 3.02.2015 - 18:28
Сообщение #436


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Добрый день!
Да просто на солнце... Будет деградация... Доступ воздуха, влага, УФ-излучение...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 20.02.2015 - 07:16
Сообщение #437


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


CAYMAN R/I/P priso1.gif

Судебная медицина - Прикрепленное изображениеСудебная медицина - Прикрепленное изображение

Сообщение отредактировал alexlp - 20.02.2015 - 07:22
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Nayk
сообщение 20.02.2015 - 08:14
Сообщение #438


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 24.12.2010
Пользователь №: 24 739


За что боролись на то и напоролись
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
chemist-sib
сообщение 20.02.2015 - 08:44
Сообщение #439


Магистр форума

Группа: Токсикологи
Регистрация: 24.02.2010
Из: Сибирь большая...
Пользователь №: 20 201


Да, "... стращать и не пущать!..". wacko.gif И работайте, рОбятки, как хотите!..
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 20.02.2015 - 10:07
Сообщение #440


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Есть способ обхода... В "Опере" включить режим "Турбо"... Иногда помогает обойти это. Другой вариант - Tor-browser. Надеюсь, за такую информацию меня никто ногами по почкам бить не будет smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KSS17
сообщение 20.02.2015 - 10:54
Сообщение #441


Мастер I
Group Icon
Группа: Модераторы
Регистрация: 15.08.2007
Пользователь №: 5 557


Здравствуйте!
Цитата(Deminolog @ 20.02.2015 - 13:07)
Есть способ обхода... В "Опере" включить режим "Турбо"... Иногда помогает обойти это. Другой вариант - Tor-browser. Надеюсь, за такую информацию меня никто ногами по почкам бить не будет smile.gif

Нет, лишь бы детям в руки не попало... smile.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Nayk
сообщение 20.02.2015 - 10:58
Сообщение #442


Опытный участник

Группа: Участники
Регистрация: 24.12.2010
Пользователь №: 24 739


Да любой банальный ВПН это лечит или воспользоваться ананимайзерами типа анимешных))) http://ani-proxy.com/
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
ncux
сообщение 20.02.2015 - 13:30
Сообщение #443


Участник форума

Группа: Участники
Регистрация: 23.06.2008
Пользователь №: 8 921


дополнение к различным браузерам для организации халявного ВПН на лету hola
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
chemist-sib
сообщение 20.02.2015 - 13:38
Сообщение #444


Магистр форума

Группа: Токсикологи
Регистрация: 24.02.2010
Из: Сибирь большая...
Пользователь №: 20 201


если продолжить немножко "околотемных" разговоров wink.gif Надо полагать, в ФСКН клинических идиотов нет - все же, комиссии всякие, психологи-тесты... и о подобных - в принципе, простых способах обхождения закрытия информации в Сети они (ответственные за это "товарищи") должны знать, ну, хоть понаслышке. т.е., это получается очередная банальная ИБД? как-то в осознанное вредительство верить не хочется, но если неповоротливое государство, в лице обязанных на то чиновников, не может обеспечить уже закупленные там и сям "железы" своевременно пополняемыми официальными базами - так пусть хотя бы не мешало делать это небольшой группе специалистов-энтузиастов... понимаю - утопично, но в очередной раз "поголовную КУКУРУЗАцию" уже надоело созерцать...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 20.02.2015 - 15:22
Сообщение #445


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(ncux @ 20.02.2015 - 15:30)
дополнение к различным браузерам для организации халявного ВПН на лету hola

cool2.gif gamer2.gif laugh.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 28 29 30 31 > » 



- Обратная связь Сейчас: 23.06.2025 - 08:36