Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )

Форум судебных медиков России
41 страниц V « < 31 32 33 34 > »   
>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 16.06.2008 - 21:41
Сообщение #1 (закреплено)


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35


Прикрепленные файлы
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_NNCN_20141108_2.zip ( 14.45 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  4102
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_SETUP.pdf ( 404.04 килобайт ) Кол-во скачиваний:  1084
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231.pdf ( 634.57 килобайт ) Кол-во скачиваний:  897
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_amdislib_20191231.zip ( 1.16 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  671
Судебная медицина - Прикрепленный файл  SUDMED_MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip ( 1.11 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  586
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_nistlib_20191231.zip ( 2.61 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  642
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary.zip ( 1.02 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  606
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_NEW.pdf ( 245.63 килобайт ) Кол-во скачиваний:  953
Судебная медицина - Прикрепленный файл  sudmed_ms_2832_lib_20191231_eng.pdf ( 581.64 килобайт ) Кол-во скачиваний:  964
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

>

Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных

Рейтинг  5
>
alexlp
сообщение 30.06.2015 - 13:37
Сообщение #476


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Tatarin_116 @ 30.06.2015 - 15:34)
Уважаемый Deminolog! Речь идет о недобросовестном присвоении бренда (АПИСИН) какой-то левой библиотеке «AIPSIN 01-2015», где-то распространяемой "спойлерами" нормального продукта... Остальное на Ваше понимание, но это бессмысленный "холивар". В первую очередь это предупреждение несет о "спойлерах" высокотехнологичного продукта. Поверьте, имея лицензию на этот продукт,мне также неоднократного пытались "добрые" чувачки впихнуть из добрых побуждений "левую" библиотеку... Эти "добрые" люди также читают данный и еще несколько других форумов biggrin.gif

Хотелось бы получить копию этого"продукта".
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 30.06.2015 - 13:50
Сообщение #477


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Да я понимаю, что это за продукт... smile.gif Даже видел пару раз, правда, не 01-2015, а более старую версию, но тоже левый явно... smile.gif Я так понимаю, кто-то потрошит базу и переделывает все под Нист... Естественно, авторы не рады такому повороту событий. Если бы это был мой источник заработка и интеллектуальный продукт, я бы, пожалуй, тоже хотел бы казнить через усаживание на кол...
Ну а остальное - это так, просто любопытства ради, прошу прощения smile.gif

Сообщение отредактировал Deminolog - 30.06.2015 - 13:50
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Tatarin_116
сообщение 30.06.2015 - 13:54
Сообщение #478


Участник форума

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 10.01.2011
Пользователь №: 24 928


Цитата(Deminolog @ 30.06.2015 - 13:50)
Да я понимаю, что это за продукт... smile.gif Даже видел пару раз, правда, не 01-2015, а более старую версию, но тоже левый явно... smile.gif Я так понимаю, кто-то потрошит базу и переделывает все под Нист... Естественно, авторы не рады такому повороту событий. Если бы это был мой источник заработка и интеллектуальный продукт, я бы, пожалуй, тоже хотел бы казнить через усаживание на кол...
Ну а остальное - это так, просто любопытства ради, прошу прощения smile.gif

Вот именно, так оно и есть! И более раннюю версию тоже доводилось не просто видеть, а именно ее и предлагали... В остальном с Вами и уважаемым Alexlp согласен (за исключением желания взглянуть на сей "продукт"). Спасибо за взаимопонимание biggrin.gif
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
KNIISE
сообщение 6.07.2015 - 12:48
Сообщение #479


Продвинутый участник

Группа: Участники
Регистрация: 16.03.2010
Пользователь №: 20 614


Markes International has announced the launch of a new web-based application that will allow users to discover how ‘soft’ electron ionisation technology could benefit their GC–MS application. The new resource, hosted at www.select-ev.com, will allow anyone to view time-of-flight mass spectra generated using Markes’ Select-eV technology. The library has been launched with the 70 eV and low-eV spectra of over 350 compounds, but will be updated quarterly...

Web-based High Resolution Mass Spectral Database (www.mzCloud.org) developed in collaboration between Thermo Fisher and HighChem (www.highchem.com , Mass Frontier)
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 9.07.2015 - 19:57
Сообщение #480


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Хех smile.gif А есть еще более веселая штука - МС/МС с электронной ионизацией при первичной ионизации с пониженной энергией электронов... Веселее всего, что на моем QqQ лучший сигнал получается в диапазоне 30-50 эВ smile.gif Чище и интенсивнее smile.gif А энергии ниже 20 эВ - большая потеря по интенсивностям сигнала. Тут уже надо в режим ХИ уходить, пожалуй, для таких энергий...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 18.07.2015 - 11:37
Сообщение #481


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2231_LIB_20150714 дополнена спектрами из библиотеки rf-des_drug_10.07.2015:

1 5-Fluoro AB-PINACA M2 (3-COOH), TMS-
2 PX-Bz-F ### [NOT CONFIRMED]
3 AB-CHFUPYCA
4 MDMB-CHMICA
5 MDMB-CHMINACA


Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 4.08.2015 - 22:37
Сообщение #482


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2242_LIB_20150805 дополнена спектрами дериватов хелиамина и металлилескалина, представленными уважаемым KSS17:

1 Methallylescaline # (2-{3,5-dimethoxy-4-[(2-methylprop-2-en-1-yl)oxy]phenyl}ethyl)amine
2 Methallylescaline N-acetyl- # N-(2-{3,5-dimethoxy-4-[(2-methylprop-2-en-1-yl)oxy]phenyl}ethyl)acetamide
3 Methallylescaline N-propionyl- # N-(2-{3,5-dimethoxy-4-[(2-methylprop-2-en-1-yl)oxy]phenyl}ethyl)propanamide
4 Methallylescaline, PFP- # N-(2-{3,5-dimethoxy-4-[(2-methylprop-2-en-1-yl)oxy]phenyl}ethyl)-2,2,3,3,3-pentafluoropropanamide
5 Methallylescaline, TMS ### [NOT CONFIRMED]
6 Heliamine # 6,7-dimethoxy-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline
7 Heliamine artefact # 6,7-dimethoxy-3,4-dihydroisoquinoline
8 Heliamine N-acetyl- # 2-acetyl-6,7-dimethoxy-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline
9 Heliamine, N-methyl- # 6,7-dimethoxy-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline
10 Heliamine, N-propionyl- # 6,7-dimethoxy-2-propionyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline
11 Helianime, PFP # 6,7-dimethoxy-2-(2,2,3,3,3-pentafluoropropanoyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline


Буду благодарен Коллегам за выявленные ошибки и не точности!
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 5.09.2015 - 19:55
Сообщение #483


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Уважаемые Коллеги!

Начался процесс государственной регистрации баз данных: уже зарегистрированы библиотеки EKBDRUGS и RFDESDRUGS.
Собственно вопрос: не пришло ли время провести эту процедуру и для SUDMED?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 7.09.2015 - 07:29
Сообщение #484


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


а что это дает? кроме "статуса"....
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
alexlp
сообщение 7.09.2015 - 12:58
Сообщение #485


Мастер II

Группа: СМЭ
Регистрация: 14.06.2008
Пользователь №: 8 835


Цитата(Korvet @ 7.09.2015 - 09:29)
а что это дает? кроме "статуса"....

Только статус официальной публикации и защита прав авторов.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Гермиона
сообщение 7.09.2015 - 14:32
Сообщение #486


Авторитетный участник

Группа: Химики-аналитики
Регистрация: 20.01.2011
Пользователь №: 25 109


Время пришло "еще вчера"...
Что для этого надо сделать?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 7.09.2015 - 14:37
Сообщение #487


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Поддерживаю. Это действительно надо сделать. Статус нужен... К сожалению, принцип "без бумажки - ты букашка" никто не отменил. Поэтому несмотря на то, что сообщество и без статуса ценит и знает, что это за труд, нужно сделать так, чтобы никакой юрист не докопался.
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 7.09.2015 - 18:30
Сообщение #488


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Цитата(Deminolog @ 7.09.2015 - 15:37)
сделать так, чтобы никакой юрист не докопался.


я конечно не юрист, но на месте юриста я бы:

1. продемонстрировал пакет документов, который нужен для создания базы (где там экспертная оценка адекватности данных)
2. создал бы подобную базу и также бы ее зарегистировал для демонстрации фиктивности этого процесса...(с точки зрения адекватности данных)

имхо, не надо путать копирайт и научность....в наше время такие вещи патентуют, что волосы дыбом встают...если мы беспокоимся что суд-мед-либ кто-то завтра начнет продавать и делать деньги, то оно конечно да, это надо...а больше-то для чего?
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Korvet
сообщение 7.09.2015 - 18:38
Сообщение #489


Магистр форума

Группа: СМЭ
Регистрация: 13.05.2009
Из: Томск
Пользователь №: 14 703


Цитата(alexlp @ 7.09.2015 - 13:58)
Только статус официальной публикации и защита прав авторов.



а может стоит сдделать просто нормальную публикацию на эту тему, где будет описан процесс внесения в БД и док-ва стр-р. сделать доклад-анонс на эту тему 6-7 числа....лучше уж публикация чем просто статус от нее...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием
Deminolog
сообщение 7.09.2015 - 19:38
Сообщение #490


Химик-аналитик

Группа: Участники
Регистрация: 12.11.2010
Из: Краснодар
Пользователь №: 24 017


Да, патентное право сейчас - это просто тихий ужас... Можно хоть ковырялку в носу механическую запатентовать, было бы желание.
Насчет экспертной оценки адекватности данных - если это рецензия - нет проблем, эта база, думаю, её выдержит достойно. Если речь идет о том, что на каждый спектр должен быть отснятый CRM - это уже фантастика, причем не только для нас...
Пользователь offline
К началу страницы
+Ответить с цитированием

41 страниц V « < 31 32 33 34 > » 



- Обратная связь Сейчас: 23.06.2025 - 21:25