[alexlp]

Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д.
Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip).

Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта http://sudmed-ms.my1.ru/

SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ

sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке.

sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь.

SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation)

sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter

sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки

SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях

SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS

Сообщение отредактировал KSS17 - 1.01.2020 - 18:35

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Кажется я нашел правильную формулировку в описании библиотеки: "Предназначена для предварительной идентификации соединений методами газожидкостной хроматографии и масс-спектрометрии".
Ваше мнение?

Сообщение отредактировал alexlp - 9.09.2015 - 15:32

[Korvet]

Уважаемые Коллеги!

Кажется я нашел правильную формулировку в описании библиотеки: "Предназначена для предварительной идентификации соединений методами газожидкостной хроматографии и масс-спектрометрии".
Ваше мнение?

по сути 100% верно, но вот я не понимаю замыслов в таком случае. Тут выше высказывалось мнение что с патентом оно весомее в суде будет....но что-то какой-то бетонный спасательный круг получается с такой формулировкой...

Сообщение отредактировал Korvet - 9.09.2015 - 18:50

[alexlp]

по сути 100% верно, но вот я не понимаю замыслов в таком случае. Тут выше высказывалось мнение что с патентом оно весомее в суде будет....но что-то какой-то бетонный спасательный круг получается с такой формулировкой...

Будем искать... http://www.youtube.com/watch?v=Qk1w6tRq7b4

[Korvet]

пишете просто предназначена для процедуры идентификации соединений методами газожидкостной хроматографии и масс-спектрометрии....

иэ этого не следует что это необходимый и достаточный инструмент идентификации, как и не следует обратного...

[alexlp]

пишете просто предназначена для процедуры идентификации соединений методами газожидкостной хроматографии и масс-спектрометрии....

иэ этого не следует что это необходимый и достаточный инструмент идентификации, как и не следует обратного...

Велик и могуч родной язык...

[Nayk]

а что такое отснятый CRM?
я думаю что Nayk пояснит, как прошедший эту процедуру возможен ли такой вариант, что допустим кто-либо завтра создаст продукт который будет называться скажем wide_word_des_drag, и где будут совершено левые спектры, возможно ли будет на такой продукт получить этот патент?...скажет ли кто-либо в ходе этой процедуры: "позвольте, а у метоксетамина, совсем иной спектр описан в этой, этой и этой статье"....

это один момент. а второй момент: а как быть с обновлением?

Да возможно, тут спору нет. Посути регистрация это зашита только НАЗВАНИЯ базы

[alexlp]

Cayman Spectral Library ChangeLog

This document contains a record of version updates and
additions/corrections to the Cayman Spectral Library. Most recent changes
are recorded at the top and ordered in reverse chronological order.

Version:
CaymanSpectralLibrary_v06032015

Release Date 06-03-15

Additions:

-MAB-CHMINACA
-5-fluoro ADB
-3-desoxy-3,4-Methylenedioxy Pyrovalerone
-Meperidine-d5
-5-methoxy Methylone
-a-Methylaminohexanophenone
-2,3-Ethylone isomer
-3-Chloromethcathinone
-3,4-dimethoxy-a-Pyrrolidinohexanophenone
-Acetyl fentanyl 4-methylphenethyl analog
-ADB-CHMICA
-5-fluoro ADB-PINACA isomer 2
-CUMYL-THPINACA
-Meperidine-d5
-Flubromazolam
-APP-CHMINACA
-FDU-NNEI
-5-fluoro CUMYL-PINACA
-APP-FUBINACA
-PCP
-3,4-Dimethoxymethcathinone
-AB-CHMINACA 2'-indazole isomer
-PCP-d5
-Phenazepam-d4
-Oxycodone-d3
-Alprazolam-d3
-DL-4662
-a-Dimethylaminopentiophenone
-4,4'-Dimethylaminorex
-6-MAPB
-a-Propylaminopentiophenone
-B-Hydroxythiofentanyl
-FUB-JWH 018
-MDMB-FUBINACA
-MO-CHMINACA
-Lorazepam
-Nitrazepam
-Diazepam-d3
-CUMYL-PINACA
-5-methoxy DPT
-5-methoxy DET
-4-fluoro PV8 piperidine analog
-7-MAPB
-Dextromethorphan-d3
-Ketazolam

[KNIISE]

В розыске библиотеки масс-спектров фрагментов пиролиза и различных полимерных добавок, известно о таковых от Shimadzu, CDS Analytical в формате AMDIS и Agilent. Ответ счастливых обладателей жду в личку.

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2244_LIB_20151001:
1.Библиотека дополнена спектрами из rf-des_drug_04.09.2015 и CaymanSpectralLibrary_v06032015:

1. 4'-Methylpropiophenone
2. α-Bromovalerophenone
3. Nitrazepam
4. Ketazolam
5. FUB-JWH 018
6. beta-Hydroxythiofentanyl
7. 4,4'-Dimethylaminorex
8. a-Dimethylaminopentiophenone
9. 3,4-Dimethoxymethcathinone
10. Acetyl fentanyl 4-methylphenethyl analog
11. MAB-CHMINACA
12. 5-methoxy Methylone
13. ADB-CHMICA

Множество позиций изменено.
Для первых 37 позиций добавлены структуры, названия ИЮПАК, CAS номера (если таковых нет, то присвоен унифицированый код = RI+MW+0).
Это делается в порядке подготовки библиотеки к регистрации (Не знаю - хватит ли моего терпения на все 2244 позиции, но стараюсь...)
С части позиций сняты теги [NOT CONFIRMED]

1. GBR-12935
2. α-PVP oxo- metabolite
3. Termoliz TMCP-022
4. RH-34
5. PB(N)-FUB
6. 4-MeO-α-PVP
7. ethyl 1-pentyl-1H-indole-3-carboxylate
8. TMCP-022
9. JWH-CHM
10. MDMB-CHMINACA
11. PX-Bz-F ### [NOT CONFIRMED]
12. PX-01
13. PX-02
14. PCP, 1-(1-phenylcyclohexyl)-piperidine 11.630
15. ALPHAPRODINE
16. paracetamol (8.650min)
17. NOREPHEDRINE 2TFA (6.55)
18. NICOTINAMID 8.583 MIN
19. AMITRIPTYLINOXYDE -(CH3)2NOH 12.198 min
20. taren comp2 12.36 (??)
21. 2C-B-NBOMe ### 10.1183 min 2CB analiog

Удалены 10 позиций, не соответствующие критериям проекта.

Для АМДИС оставлен только формат MSP.
Это связано с тем, что в формате MSL+CID необходимо наличие уникальных номеров CAS для группировки разных спектров одного и того же соединения.
Кроме того при конвертации из формата NIST в MSP и затем в MSL теряется важная информация о синонимах.

Эта версия SUDMED_2244_LIB_20151001 будет включена в новые редакции информационных писем ННЦ, которые выйдут после предстоящих семинаров/конференций.

[Korvet]

Добрый день!
возможно уже выкладывали конечно...
PPA-2201 (N-(1-Carbamoyl-2-phenylethyl)-1-(5-fluoropentyl)-1H-indole-3-carboxamide),точнее говоря его карбокси метаболит, продукт гидролиза

сварен из сырья, посмотрен на ВЭЖХ-мс-мс...увы спектр не выраженный, от ММВ-2201, его отличает только молекулярник, но он слабый. Метильный сварить пока не могу, объекта было мало, объект кончился!

 NEW_SP.rar ( 1.05 мегабайт ) Кол-во скачиваний:  325


Сообщение отредактировал Korvet - 24.10.2015 - 09:31

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2259_LIB_20151205:
1.Библиотека дополнена спектрами из rf-des_drug_06.11.2015, Designer Drugs Online: https://db12.designer-drugs.de/login.pl и от уважаемого GCUber:
1 Deschloroketamine
2 2C-C-NBOMe
3 2C-C
4 AB-PINACA
5 AB-FUBINACA
6 Asenapine
7 Asenapine
8 Fenspiride TMS
9 Fenspiride
10 6-Desoxycodeine
11 6-Desoxycodeine
12 3,6-Didesoxydihydronormorphine
13 Desomorphine methyl ester
14 3,6-Didesoxydihydromorphine
15 Desomorphine
16 3,5-5F-AB-FUPPYCA

Множество позиций изменено: добавлены структуры, названия ИЮПАК, CAS номера (если таковых нет, то присвоен унифицированый код = RI+MW+0).
Это делается в порядке подготовки библиотеки к регистрации.

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2279_LIB_20151224: спектра дигидро метаболитов PVP и метаболитов Меторфана любезно представлены уважаемым A58!

1 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) PFP isomer 1
2 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) Ac isomer 1
3 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) Ac isomer 2
4 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) isomer 1
5 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) isomer 2
6 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) PrO isomer 1
7 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) PrO isomer 2
8 alpha-PVP M(Oxo=, dihydro-) TFA
9 alpha-PVP M(dihydro-)
10 Alpha-PVP M(dihydro-) Ac
11 alpha-PVP M(dihydro-) PFP
12 alpha-PVP M(dihydro-) PrO
13 alpha-PVP M(dihydro-) TFA
14 alpha-PVP M(dihydro-) TMS
15 Methorphan-M (N,O-didesmethyl-) 2 Ac
16 Methorphan-M (O-desmethyl-) Ac
17 Methorphan-M (nor-) AC
18 Methorphan-M 2AC
19 Methorphan-M AC
20 Methorphan-M (methoxy-O-desmethyl-) Ac

Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке!

[alexlp]

Уважаемые Коллеги!

Благодаря уважаемому Tatarin выкладываю последнее обновление библиотеки CaymanSpectralLibrary_v10302015 в форматах AMDIS, NIST, Agilent ChemStation.

Cayman Spectral Library ChangeLog

This document contains a record of version updates and
additions/corrections to the Cayman Spectral Library. Most recent changes
are recorded at the top and ordered in reverse chronological order.




Version:
CaymanSpectralLibrary_v10302015

Release Date 10-30-15

Removed:
Cannabidiolic Acid

Corrected:
Oxycodone-d3

Additions:
-Metaxalone
-Oxazepam-d5
-FUB-NPB-22
-MAB-CHMINACA metabolite M11
-XLR11 N-(4-hydroxypentyl) metabolite-d5
-NM2201
-AB-CHFUPYCA isomer 2
-Temazepam-d5
-5-fluoro PCN
-Heroin-d3
-6-methoxy Methylone (hydrochloride)
-Lisdexamfetamine (mesylate)
-AB-CHFUPYCA isomer 1
-Diazepam-d8
-Temazepam-d8
-3-MAPB (hydrochloride)
-Clonazepam-d4
-Carisoprodol
-Meprobamate
-MAM2201-d5
-XLR11 N-(4-hydroxypentyl) metabolite
-LH 21
-6-MAM
-Lorazepam
-Meperidine (hydrochloride)
-CUMYL-PICA
-5-chloro AKB48
-Adinazolam
-AM2201 5-hydroxyindole metabolite
-bk-EABDI (hydrochloride)
-Norfentanyl-d5
-para-Fluorobutyryl fentanyl (hydrochloride)
-AZ-037 isomer 1
-5-fluoro AMP Indole
-MMB-CHMICA
-Meprobamate-d7
-5-fluoro PY-PINACA
-Alprazolam-d8
-4-fluoro IPV (hydrochloride)
-Flurazepam-d10
-3,4-Methylenedioxy-PV8 (hydrochloride)
-17�-Hydroxy-androstano[3,2-c]isoxazole
-5-fluoro PB-22 3-carboxyindole metabolite-d5
-Alprazelam-d8
-Diazepam-d5
-Naltrexone-d4
-ALEPH-4
-ALEPH-2
-Arachidonoyl Ethanolamide
-R-1 Methanandamide
-F2201
-Prolintane (hydrochloride)
-UWA-101 (hydrochloride)
-Norfentanyl
-3,4-Methylenedioxy-PV8 (hydrochloride)
-Methoxmetamine (hydrochloride)

-MAB-CHMINACA metabolite M10
-Nordiazepam-d5
-Estra-4,9,11-triene-3,17-dione
-AB-FUBINACA metabolite 3
-Amobarbital
-Alprazolam-d5
-Methiopropamine 3�-thiophene isomer (hydrochloride)
-MAB-CHMINACA metabolite M7
-MAB-CHMINACA metabolite M1
-Phentermine (hydrochloride)
-Phentermine-d5 (hydrochloride)
-Cannabidiol
-2-APB (hydrochloride)
-CI-994
-APP-PICA
-5-fluoro AEB
-Cannabidiol-d9
-MMDA (hydrochloride)
-MMDMA (hydrochloride)
-MAM2201-d5
-Nitrazepam-d5
-3-Fluorophenmetrazine (hydrochloride)
-BMPEA (hydrochloride)
-Codeine-d3
-Flurazepam
-Isobutyl 1-pentyl-1H-indazole-3-carboxylate
-Cyclobenzaprine-d3 (hydrochloride)
-Mephedrone-d3 (hydrochloride)
-MiPT
-MDA 2-aldoxime analog
-MDA 2-amido analog

-5-methoxy EiPT
-NNEI 2'-indazole isomer
-Dihydrocodeine

С наступающими Новогодними праздниками!

[alexlp]

http://sdbs.db.aist.go.jp/sdbs/cgi-bin/cre_index.cgi

Welcome to Spectral Database for Organic Compounds, SDBS.
This is a free site organized by National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Japan.

NMR: T.Yamaji, T.Saito, K.Hayamizu, M.Yanagisawa and O.Yamamoto
MS: N.Wasada
ESR: K.Someno
IR: S.Kinugasa, K.Tanabe and T.Tamura
Raman: K.Tanabe and J.Hiraishi

Introduction to the Spectral Data Base (SDBS)
SDBS is an integrated spectral database system for organic compounds,which includes 6 different types of spectra under a directory of the compounds. The six spectra are as follows, an electron impact Mass spectrum (EI-MS), a Fourier transform infrared spectrum (FT-IR), a 1H nuclear magnetic resonance (NMR) spectrum, a 13C NMR spectrum, a laser Raman spectrum, and an electron spin resonance (ESR) spectrum. We started the studies on the spectral database system in early 1970s. The construction of the database in the present format was started in 1982 in a mainframe computer that was finished at the end of March 1999. In 2001, National Metrology Institute of Japan (NMIJ) under National Institute of Advanced Industrial Science and technology (AIST) started to manage and to maintain the SDBS. Currently, EI-MS spectrum, 1H NMR spectrum,13C NMR spectrum, FT-IR spectrum, and the compound dictionary are active for correcting and maintenance of the data. Since 1997, SDBS has opened to the public with free of charge through TACC (Tsukuba Advanced Computing Center) as RIO-DB (Research Information Data Base). The total accumulated number of access almost reached 550 million at the end of January, 2015. SDBS is a fact database that contains spectral pattern and has been an important database that sends information from Japan to all over the world. The numbers of the data present at the end of May, 2015 were as follows.
Compounds: ca 34600 compounds updated
MS: ca 25000 spectra updated
1H NMR: a 15900 spectra updated
13C NMR: ca 14200 spectra updated
FT-IR: ca 54100 spectra updated
Raman: ca 3500 spectra
ESR: ca 2000 spectra

[KNIISE]

SWGDRUG MS Library Version 2.4 (December 30, 2015)