Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() ![]() |
![]() |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#1 (закреплено) |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Давайте выкладывать свои мини-базы в общий доступ! Cвободное ПО и открытые исходники - Это путь прогресса!
Cтоит указывать для каких ПО библиотеки: Эджилент, Финниганматт, Шимазу, поисковик АМДИС, и т.д. Очень желательно сжатие свободным алгоритмом zip (например с помощью 7zip). Загрузить полный пакет библиотек вы можете как со страницы форума, так и с нового сайта проекта SUDMED_NNCN_20141108.zip - Пакет библиотек масс-спектров 1.1 к информационным письмам ФГБУ ННЦ НАРКОЛОГИИ sudmed-ms_2832_amdislib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку MSP, которые выкладывались в этой ветке. sudmed-ms_2832_nistlib_20191231.zip - все маленькие кастомные базы собранные в одну библиотеку сконвертировую в НИСТсёчь. SUDMED-MS_2832_ACSLIB_20191231.L.zip - библиотека в формате хемстанции (Agilent ChemStation) sudmed-ms_2832_MSHUNLIB_20191231.mslibrary - библиотека в формате Agilent MassHunter sudmed-ms_2832_lib_20191231.pdf - индексный список содержимого библиотеки SUDMED-MS_2832_LIB_20191231_new.pdf - сведения об обновлениях SUDMED_MS_SETUP.pdf - инструкция по установке библиотек SUDMED-MS Прикрепленные файлы ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
Библиотеки масс-спектров, Масс-спектры сравнения, базы данных |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#521 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Теперь и для АМДИС ![]() Содержание дополнений ![]() |
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#522 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Уважаемые Коллеги!
Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2283_LIB_20160209, добавлены позиции: 2280) Skatol ### Indole, 3-methyl- 2281) Gabapentin Lactam-TMS 2282) Gabapentin lactam 2283) Gabapentin-TMS Буду благодарен за спектр или хроматограмму нативного Gabapentin и Gabapentin lactam -ME для включения в библиотеку (имеющиеся в DD2012 спектры не является contributed, и поэтому не могут быть просто скопированы). Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке! |
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#523 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Уважаемые Коллеги!
Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2286_LIB_20160224. Добавлены позиции нового СК APINAC ### AKB-57 и спектры его предполагаемого специфичного маркера - Adamantanol: 2284) APINAC ### AKB-57 ### AKB57 ### ACBL(N)-018 # Adamantyl-1-pentyl-1Hindazole-3-carboxylate 2285) 2-Adamantanol, TMS derivative 2286) 1-Adamantanol Увы, свободных для копирования спектров дериватов 1-Adamantanol в доступных библиотеках не нашел. Надеюсь, что спектр 2-Adamantanol, TMS derivative не сильно будет отличаться от спектра 1-Adamantanol ТМС. Если общими усилиями удастся его изловить - обновим. Второй, не специфичный, основной маркер может идентифицироваться, как AB-PINACA-M6 (3-COOH), methyl-, т.е. в виде дериватов пентил-индазольной кислоты. Следует так же обращать внимание на случаи обнаружения фтор-бензил, фтор-пентил и циклогексилметил-индазольной кислоты и ее гидроксилированных и карбоксилированных и оксо метаболитов в виде соответствующих дериватов совместно с адамантанолом. Некоторые спектры всех этих маркеров уже есть в библиотеке и названы по именам первых представителей этих семейств. Буду благодарен за спектр или хроматограмму нативного APINAC из реальных вещ.доков, и его метаболитов-маркеров - из реальных мочей (NB! Предполагается, что как и все карбоксилаты APINAC в моче будет присутствовать только в виде осколков от гидролиза). Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке! PS: для Адамантанола во всем диапазоне рН LogP=2,16, т.е. можно предположить, что он будет экстрагироваться при любых значениях рН. |
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#524 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Уважаемые Коллеги!
Очередная сборка сводной библиотеки SUDMED_2288_LIB_20160314, добавлены позиции от уважаемого Korvet: 2287) Pyrovaleron-COOH(TMS) 2288) Pyrovalerone Буду искренне благодарен за выявленные ошибки и не точности в библиотеке! |
![]() |
![]() |
Constantin |
![]()
Сообщение
#525 |
Вновь прибывший Группа: Пользователи Регистрация: 19.04.2016 Пользователь №: 43 761 ![]() |
Добрый день Всем.
Случайно наткнулся на Ваш форум, почитав интересные темы и ответы, очень понравился. Надеюсь поможете в поисках списка пестицидов от Agilent. Он прилагаться к DRS программе. В этом списке описано название аналита, m/z и время удерживание. Он идет в формате (*.doc) примерно вот так: Name______m/z_____RT Chlordane__375_____11.415 Заранее благодарен все за помощь. |
![]() |
![]() |
Korvet |
![]()
Сообщение
#526 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 ![]() |
Всем добрый день!
у нас кажется новинки. предположительно фтор-пирролидингексанофенон и N-этильный аналог бутилона. Во вложении msp с тремя спектрами (фтор-пирролидингексанофенон, N-метильный аналог бутилона и его ацетильное производное ) и их RI. А также хроматограмма со всеми тремя. Малость перегрузил, видать забыл уж как с нативами работать! ![]() |
![]() |
![]() |
Korvet |
![]()
Сообщение
#527 |
Магистр форума Группа: СМЭ Регистрация: 13.05.2009 Из: Томск Пользователь №: 14 703 ![]() |
ой, тысяча извинений. не N-метильный аналог бутилона, а N-этильный аналог бутилона, то есть вместо метильной группы при азоте - этильная.
|
![]() |
![]() |
KNIISE |
![]()
Сообщение
#528 |
Продвинутый участник ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Группа: Участники Регистрация: 16.03.2010 Пользователь №: 20 614 ![]() |
|
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#529 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
Свежая SWGDRUG теперь и для AMDIS:
|
![]() |
![]() |
АМД |
![]()
Сообщение
#530 |
Опытный участник ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 ![]() |
[Уважаемые коллеги, подскажите пожалуйста, как эту библиотеку SWGDRUG установить, чтобы она работала с AMDIS? Я пробовал но ничего не получилось.
|
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#531 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
|
![]() |
![]() |
АМД |
![]()
Сообщение
#532 |
Опытный участник ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 ![]() |
я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека?
|
![]() |
![]() |
alexlp |
![]()
Сообщение
#533 |
Мастер II Группа: СМЭ Регистрация: 14.06.2008 Пользователь №: 8 835 ![]() |
я пытался распаковать файл, который для АМДИС, но выскакивает сообщение "не удалось открыть этот пакет исправлений". Что именно нужно сделать с этим файлом? На комне стоит АМДИС, в нем есть старая библиотека SWGDRUG А этот файл это обновление или новая библиотека? Не нужно запускать MSP файл! Положите его к библиотекам АМДИСа и подключите как целевую библиотеку. |
![]() |
![]() |
АМД |
![]()
Сообщение
#534 |
Опытный участник ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() Группа: Химики-аналитики Регистрация: 12.01.2011 Пользователь №: 24 970 ![]() |
То есть этот файл положить в папку там где старый SWGDRUG и sudmed и проделать такую же процедуру как в инструкции для библиотеки sudmed? Приношу свои извинения за такие элементарные вопросы, но я это делаю в первый раз. При настройке ГХМС нам все это сделал инженер, при этом он делал все так быстро, что я не успел проследить за действиями и записать
|
![]() |
![]() |
zavlab |
![]()
Сообщение
#535 |
Участник форума ![]() ![]() ![]() ![]() Группа: Химики-аналитики Регистрация: 6.06.2009 Из: Могилев Пользователь №: 15 240 ![]() |
Файл swgdrug_amdis_20160714.MSP поместить по пути диск:\nist14\amdis32\LIB\, затем в программе амдис 32 как обычно выбрать библиотеку: Analisys\setting\libr\select new
|
![]() |
![]() |
![]() ![]() |
![]() |
Сейчас: 24.06.2025 - 10:44 |