[Максим1977]

Здравствуйте, форумчане!
В общем заказал через знакомого экспертизу на отцовство.
Дал свою и ребенка - мальчика кровь на марле.
Через неделю получил ответ, что родство на лицо.
Эксперт выдал бумажку, но ничаго не пойму.
Огромная просьба помочь мне с расшифровкой!
Кстати экспертиза прошла на аппарате Секвинатор.

Заранее благодарен!!!

[Зубр]

Уважаемый 'Максим1977'!
Странно, что Вам выдали бумажку без комментариев. Однако, отцовство в данном случае не исключается. В левом крайнем столбце перечислены системы генетического анализа. У предполагаемого отца и ребёнка по каждой из этих систем есть одинаковые генетические признаки, что и свидетельствует о неисключении отцовства.
Удачи.

[Genetik]

Уважаемый Максим1977! В каком учреждении и кто делал Вам эту экспертизу?

[Максим1977]

Делали в ЭКЦ. Делал неофициально. Через знакомую....

Однако, отцовство в данном случае не исключается.

Спасибо Вам за ответ!
Еще вопрос. А можно имея эти данные, определить в процентном соотношении.
Например, 99,99 % или 99, 7....% ?

Уважаемые, может кто-нибудь перевести на обычный язык вэт это - " Если в образце ребенка присутствуют как минимум два несовпадающих аллеля с аллелями предполагаемого отца (матери) по одноименному хромосомному локусу и не сделано методических ошибок, то делается вывод об исключении отцовства (материнства). "

[someone]

Уважаемые, может кто-нибудь перевести на обычный язык вэт это - " Если в образце ребенка присутствуют как минимум два несовпадающих аллеля с аллелями предполагаемого отца (матери) по одноименному хромосомному локусу и не сделано методических ошибок, то делается вывод об исключении отцовства (материнства). "

имеется в виду следующее. В каждом локусе (участке) сидит два аллеля, один на одной хромосоме другой на парной. Ребенок взял их от родителей, значит в каждом локусе у ребенка должен быть по крайней мере один аллель как у отца и один - как у матери. Допустим в некотором локусе ситуация такая:

Ребенок: 17,18
Предполагаемый папа: 19,19
Мама: 16,17

тогда мама может быть мамой а претендующий на отцовство мужчина папой не является. Но например такой папой может быть:

Предполагаемый папа #2: 16,18

Сообщение отредактировал someone - 23.03.2009 - 16:31

[Максим1977]

имеется в виду следующее. В каждом локусе (участке) сидит два аллеля, один на одной хромосоме другой на парной. Ребенок взял их от родителей, значит в каждом локусе у ребенка должен быть по крайней мере один аллель как у отца и один - как у матери. Допустим в некотором локусе ситуация такая:

Ребенок: 17,18
Предполагаемый папа: 19,19
Мама: 16,17

тогда мама может быть мамой а претендующий на отцовство мужчина папой не является. Но например такой папой может быть:

Предполагаемый папа #2: 16,18

Спасибо Вам за ответ.
В моем случае, из 15 локусов, 8 аллелей у ребенка мне не свойственны. А значит, они должны быть свойственны маме. Ну, как минимум 7. А, если, 6, то отцом я не являюсь. Я правильно понял?

[Зубр]

Спасибо Вам за ответ.
В моем случае, из 15 локусов, 8 аллелей у ребенка мне не свойственны. А значит, они должны быть свойственны маме. Ну, как минимум 7. А, если, 6, то отцом я не являюсь. Я правильно понял?

Уважаемый 'Максим1977'!
Вы опираетесь на ту картинку-таблицу, которую привели? Тогда откуда Вы взяли, что есть несвойственные Вам аллели у ребёнка? Прежде всего, следующий постулат: ребёнок получает половину генетического материала от истинного или биологического отца и вторую половину - от биологической матери. Генетические признаки матери мы проанализировать не сможем - в Вашей таблице её генотипа нет. Есть Ваш (предполагаемый отец) и ребёнка. По каждой системе анализа (их 15 + шестнадцатый - пол) у Вас и ребёнка имеется хотя бы по одному одинаковому генетическому признаку (аллели). Более того, кто-то даже обвёл их кружочками . Почему-то пропущены системы D13S317 и D21S11, хотя эти системы также не исключают отцовства. Так что, исходя из Ваших рассуждений - из 15 локусов (систем генетического анализа) 15 аллелей (генетических признаков) совпадают у Вас и ребёнка. Это лишь предпосылка к признанию Вас биологическим отцом данного ребёнка. Дело в том, что вероятность отцовства с 15-ю системами и невозможностью проанализировать мать, будет составлять чуть более 99% (прикидочно). А нормативы предусматривают несколько большую величину. Надо бы продолжить исследования и поставить дополнительно ещё систем 5.
Тогда всё будет железно .
Удачи.

[someone]

Из редких для русской популяции аллелей я вижу только совпадающий D8S1179*16. Никакой экзотики, поэтому усилить выводы нечем, в сумме вероятность примерно как указал Вам ув. Зубр. Хотите знать точнее - закажите официально стандартный тест с бОльшим количеством локусов.

[Genetik]

Здравствуйте, форумчане!
В общем заказал через знакомого экспертизу на отцовство.
Дал свою и ребенка - мальчика кровь на марле.
Через неделю получил ответ, что родство на лицо.
Эксперт выдал бумажку, но ничаго не пойму.
Огромная просьба помочь мне с расшифровкой!
Кстати экспертиза прошла на аппарате Секвинатор.

Заранее благодарен!!!

Уважаемый Максим1977! Результаты, приведенные в таблице, говорят о том, что именно Вы являетесь отцом. Этому свидетельствует высокий индекс отцовства - более 280 млн (!), а вероятность того, что именно Вы являетесь отцом составляет 99,9999997%. Для расчета использовал частоты из мануала к тест-системе Айдентифайлер (ведь по ней и проводилось типирование). Если пересчитать по другим частотам отличие могут быть максимум на порядок в ту или иную сторону. Но для Вашего случая это уже не существенно. Если у Вас есть лишние деньги и время, можете еще провериться и по другим локусам. Но уверяю Вас, как показывает мой немалый опыт, результат будет тот же.
А по сему от души поздравляю Вас - Вы отец (если у Вас конечно нет брата-близнеца)!!!
Удачи.

[Зубр]

Уважаемый Максим1977! Результаты, приведенные в таблице, говорят о том, что именно Вы являетесь отцом. Этому свидетельствует высокий индекс отцовства - более 280 млн (!), а вероятность того, что именно Вы являетесь отцом составляет 99,9999997%. Для расчета использовал частоты из мануала к тест-системе Айдентифайлер (ведь по ней и проводилось типирование). Если пересчитать по другим частотам отличие могут быть максимум на порядок в ту или иную сторону. Но для Вашего случая это уже не существенно. Если у Вас есть лишние деньги и время, можете еще провериться и по другим локусам. Но уверяю Вас, как показывает мой немалый опыт, результат будет тот же.
А по сему от души поздравляю Вас - Вы отец (если у Вас конечно нет брата-близнеца)!!!
Удачи.

Уважаемый коллега 'Genetik'!
Не получится такая высокая вероятность. Даже если бы доступна для анализа была мать, то и тогда шесть 9 после запятой - редко получается. А здесь - только отец и ребёнок. Пересчитывать надо Ваши результаты, но только не популяционные частоты аллелей менять, а формулы подсчёта - у Вас они настолько либеральны, что... В общем, дело в консервативности подходов.
Всем привет.

[Genetik]

Уважаемый коллега 'Genetik'!
Не получится такая высокая вероятность. Даже если бы доступна для анализа была мать, то и тогда шесть 9 после запятой - редко получается. А здесь - только отец и ребёнок. Пересчитывать надо Ваши результаты, но только не популяционные частоты аллелей менять, а формулы подсчёта - у Вас они настолько либеральны, что... В общем, дело в консервативности подходов.
Всем привет.

ОК, уважаемый Зубр, жду Вашего пересчета результатов.

[Gordiz]

Вы являетесь отцом составляет 99,9999997%. Для расчета использовал частоты из мануала к тест-системе Айдентифайлер (ведь по ней и проводилось типирование). Если пересчитать по другим частотам отличие могут быть максимум на порядок в ту или иную сторону.

Уважаемый Genetik!
Из любопытства сделал пересчет с использованием частот германской популяции. (Благо, современные программы не требуют для этого особых затрат времени).
Результат: 99.99999865%. Очевидно немцы более гомогенны чем белые американцы, но для окончательного результата это не имеет никакого значения.

Очень интересен вопрос, затронутый уважаемым Зубром относительно алгоритмов расчета. Как я понимаю, мы с Genetik'ом использовали один и тот же алгоритм расчета Likelihood Ratio, используемый во всем мире и описанный во всех книжках, посвященных анализу генетических данных (например, B. Weir, Genetic Data Analysis II). То есть практически в любой лаборатории мира Максим1977 получил бы ответ, близкий к полученному нами с Genetik'ом. Но только не в российских лабораториях СМЭ.

В свое время Чарльз Бреннер на конкретных примерах продемонстрировал, что алгоритм RMNE (random man not excluded), до сих пор используемый у нас в СМЭ чаще всего консервативен в случае оценки истинного отцовства, а в отношении случайного неродственного индивида наоборот, менее консервативен, чем LR. По его мнению RMNE не пригоден для анализа генотипов STR-маркеров, поскольку не учитывает природу этих данных (существование гомо- и гетерозигот по совпадающему признаку, существование нуль-аллелей и мутаций и т.д.) Но это частное мнение мэтра.

Вряд ли имеет смысл обсуждать, какой алгоритм "боле правильный". Скорее всего однозначного ответа на этот вопрос не существует. Интересно узнать мнение экспертов: есть ли необходимость в переходе на общую систему координат с внешним миром? Ведь бывают экспертизы, выполняемые в сотрудничестве с зарубежными коллегами.

[Максим1977]

Огромное Всем СПАСИБО за ответы!!!
Теперь осталось ( для спокойствия души ) взять кровь у мамы.