Иерархия бюро СМЭ

Подскажите, пожалуйста кому подчиняется
"Бюро судебно-медицинской экспертизы министерства здравоохранения Московской области" ?
(кто вышестоящее ведомство)

Министерство здравоохранения Московской области - административное подчинение. По проведению экспертиз - никому.

Т.е. если есть сомнения в объективности оценки, обжаловать в Министерство здравоохранения?

А как вообще тогда можно обжаловать результаты экспертизы?

Обжаловать можно только в суде, если идет следствие - у следователя.

А если дело закрыто, вред средний..
Человек подаёт гражданский иск + приносит результат исследования, кого-то центра, что вред тяжкий?
Могут ли достать дело из архива?

Вы задаете уже чисто юридические вопросы.
В РФ никакой иерархии Бюро или центров СМЭ не существует.