"Концентрирование" амплификата



Форум судебных медиков России > Судебная медицина и судебно-медицинская экспертиза > Судебно-медицинская генетика
prostochock
Здравствуйте!
Вопрос такой. Возможно ли использовать Amicon для "концентрирования" амплификата. Сейчас объясню что имею ввиду. Получили амплификат объемом 25мкл, который содержит кучу "мусора" (неотработанные праймеры, NTP и тд). К тому же на форез берем лишь 1 мкл от всех ампликонов. Таким образом, при работе с объектами трудными профиль либо не выходит, либо частичный.
Вопрос поры амикона не слишком ли велики для наших ампликонов? И как я понимаю есть Amicon с различным размером пор (или я заблуждаюсь?)

Заранее спасибо.


Razum72
Добрый день, уважаемые форумчане!
Рrostochock, амиконы существуют с различным размером пор. Размер пор определяется способностью пропускать вещества в зависимости от их молекулярной массы (Mr), последняя измеряется в килодальтонах, т.о. колонка Амикон 100кДа пропускает все, что по Mr меньше 100кДа. Вам необходимо рассчитать диапазон Mr ваших ампликонов (http://molbiol.edu.ru/appendix/02_02.html) и подобрать соответствующую колонку. Если Вы имеете ввиду "стандартный" идентификационный анализ ПДАФ-типа, то подойдет Амикон 0,5 100кДа, только, по моему мнению, это Вам никаким образом не поможет, избавление от "мусора" в амплификате не решит проблему "частичного" профиля. Всего доброго.


prostochock
Цитата(Razum72 @ 1.11.2015 - 10:29)
Добрый день, уважаемые форумчане!
Рrostochock, амиконы существуют с различным размером пор. Размер пор определяется способностью пропускать вещества в зависимости от их молекулярной массы (Mr), последняя измеряется в килодальтонах, т.о. колонка Амикон 100кДа пропускает все, что по Mr меньше 100кДа. Вам необходимо рассчитать диапазон Mr ваших ампликонов (http://molbiol.edu.ru/appendix/02_02.html) и подобрать соответствующую колонку. Если Вы имеете ввиду "стандартный" идентификационный анализ ПДАФ-типа, то подойдет Амикон 0,5 100кДа, только, по моему мнению, это Вам никаким образом не поможет, избавление от "мусора" в амплификате не решит проблему "частичного" профиля. Всего доброго.

Большое Вам спасибо. Вроде мои ампликоны не должны провалиться) о результах отпишусь, если интересно)


Русская версия Invision Power Board © 2001-2017 Invision Power Services, Inc.

© 2002-2015 Форум судебных медиков
При копировании материалов сайта размещение активной ссылки на источник обязательно!