Цитата
мне кажется, что данные вопросы не относятся к компетенции смэ, а необходимо именно назначать экспертизу качества мед. помощи, но уже судебную
Относятся. К производству судебно-медицинской экспертизы, в таком случае, привлекаются соотв. клинические специалисты (в данном случае - ортопед-травматолог(-и), при необходимости - и иные специалисты).
Цитата
к тому же бюро смэ подчиняется департаменту здравоохранения, нет гарантий независимости
Все кому-то подчиняются и т.п., все потенциально могут иметь какие-то интересы. Или не иметь. 100% гарантий того или другого нет.
Для самоуспокоения ходатайствуйте о назначении экспертизы в Бюро СМЭ другого субъекта Федерации.