Цитата(Genetik @ 24.03.2009 - 20:35)
Вы являетесь отцом составляет 99,9999997%. Для расчета использовал частоты из мануала к тест-системе Айдентифайлер (ведь по ней и проводилось типирование). Если пересчитать по другим частотам отличие могут быть максимум на порядок в ту или иную сторону.
Уважаемый Genetik!
Из любопытства сделал пересчет с использованием частот германской популяции. (Благо, современные программы не требуют для этого особых затрат времени).
Результат: 99.99999865%. Очевидно немцы более гомогенны чем белые американцы, но для окончательного результата это не имеет никакого значения.
Очень интересен вопрос, затронутый уважаемым Зубром относительно алгоритмов расчета. Как я понимаю, мы с Genetik'ом использовали один и тот же алгоритм расчета Likelihood Ratio, используемый во всем мире и описанный во всех книжках, посвященных анализу генетических данных (например, B. Weir, Genetic Data Analysis II). То есть практически в любой лаборатории мира Максим1977 получил бы ответ, близкий к полученному нами с Genetik'ом. Но только не в российских лабораториях СМЭ.
В свое время Чарльз Бреннер на конкретных примерах продемонстрировал, что алгоритм RMNE (random man not excluded), до сих пор используемый у нас в СМЭ чаще всего консервативен в случае оценки истинного отцовства, а в отношении случайного неродственного индивида наоборот, менее консервативен, чем LR. По его мнению RMNE не пригоден для анализа генотипов STR-маркеров, поскольку не учитывает природу этих данных (существование гомо- и гетерозигот по совпадающему признаку, существование нуль-аллелей и мутаций и т.д.) Но это частное мнение мэтра.
Вряд ли имеет смысл обсуждать, какой алгоритм "боле правильный". Скорее всего однозначного ответа на этот вопрос не существует. Интересно узнать мнение экспертов: есть ли необходимость в переходе на общую систему координат с внешним миром? Ведь бывают экспертизы, выполняемые в сотрудничестве с зарубежными коллегами.